RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626874.2

CHD2-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CHD2, Length 7,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD2-208	ENST00000626874	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874		H0Y9P7	68 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	ACAN	P16112	2415 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	COX6A2	Q02221	97 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	IGF2R	P11717	2491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	CRYGA	P11844	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	PROK1	P58294	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	ACYP2	P14621	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874		Q6ZRP5	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	FHL2	Q14192	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	MDFI	Q99750	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874		Q6Q795	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	CRIP1	P50238	77 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	CXCL6	P80162	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874		A0A087WSZ3	146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874		H3BPC8	53 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	SPINK1	P00995	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874		A0A0U1RQV1	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	SMR3A	Q99954	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874		Q8NBF4	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	XG	P55808	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874		A0A1B0GU69	56 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	LINC00313	P59037	77 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CHD2-208	ENST00000626874	PRR4	Q16378	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	AMELX	Q99217	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	MOBP	Q13875	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	PRR9	Q5T870	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	PRLH	P81277	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874		Q8N3U1	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874		Q6ZS46	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	MTOR	P42345	2549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	RTL8C	O15255	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	WISP2	O76076	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874		A8MZ25	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	BCE1	O60756	84 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	AVP	P01185	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874		Q6ZRU5	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHD2-208	ENST00000626874	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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