RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 PF4P02776 101 aa9.23□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 PFN2P35080 140 aa9.23□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.23□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 Q8N3U1 123 aa9.22□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.22□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.22□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 XCL1P47992 114 aa9.22□□□□□ -0.93
C9orf170-201ENST00000623052 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GUV1 79 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB4AO15263 64 aa9.19□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC179H3BU77 68 aa9.19□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 MALP21145 153 aa9.18□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 LY6G6DO95868 133 aa9.18□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 PRO0255Q9UI72 69 aa9.18□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 ATP5G1P05496 136 aa9.17□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA0087Q14695 138 aa9.17□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 Q8IZM0 81 aa9.17□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 HIVEP2P31629 2446 aa9.17□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.16□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB135Q30KP9 77 aa9.16□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 PAX4O43316 350 aa9.15□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 ACYP1P07311 99 aa9.15□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 SS18Q15532 418 aa9.15□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.15□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 Q8NDZ9 215 aa9.15□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 CELA1Q9UNI1 258 aa9.15□□□□□ -0.94
C9orf170-201ENST00000623052 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 B5MCH6 92 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 J3QKU1 62 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 LECT2O14960 151 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 SLPIP03973 132 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 LYRM9A8MSI8 78 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 HIVEP1P15822 2718 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 H0YGX0 51 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.11□□□□□ -0.95
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C9orf170-201ENST00000623052 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.11□□□□□ -0.95
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C9orf170-201ENST00000623052 LINC00643Q86TS7 51 aa9.1□□□□□ -0.95
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C9orf170-201ENST00000623052 DNAL4O96015 105 aa9.1□□□□□ -0.95
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C9orf170-201ENST00000623052 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 REG3AQ06141 175 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf170-201ENST00000623052 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.09□□□□□ -0.95
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C9orf170-201ENST00000623052 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.96
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C9orf170-201ENST00000623052 C10orf25Q5T742 122 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf170-201ENST00000623052 C6orf223Q8N319 242 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf170-201ENST00000623052 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
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C9orf170-201ENST00000623052 NDUFC2O95298 119 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf170-201ENST00000623052 COX17Q14061 63 aa9.05□□□□□ -0.96
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C9orf170-201ENST00000623052 LINC00846Q9NV44 126 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf170-201ENST00000623052 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf170-201ENST00000623052 APOC4P55056 127 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf170-201ENST00000623052 CFAP161Q6P656 301 aa9.04□□□□□ -0.96
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C9orf170-201ENST00000623052 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf170-201ENST00000623052 Q8N814 137 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf170-201ENST00000623052 ATRQ13535 2644 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf170-201ENST00000623052 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf170-201ENST00000623052 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
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C9orf170-201ENST00000623052 HTN3P15516 51 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf170-201ENST00000623052 PRR34Q9NV39 138 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
C9orf170-201ENST00000623052 ENHOQ6UWT2 76 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf170-201ENST00000623052 LELP1Q5T871 98 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf170-201ENST00000623052 C3orf56Q8N813 242 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9□□□□□ -0.97
C9orf170-201ENST00000623052 SPAG11BQ08648 103 aa9□□□□□ -0.97
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM126AQ9H061 195 aa9□□□□□ -0.97
C9orf170-201ENST00000623052 C6orf99Q4VX62 202 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf170-201ENST00000623052 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf170-201ENST00000623052 KLK12Q9UKR0 248 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf170-201ENST00000623052 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.98□□□□□ -0.97
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