RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599939.1

TIMM44-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, human

Gene TIMM44, Length 2,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM44-210	ENST00000599939	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TIMM44-210	ENST00000599939	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TIMM44-210	ENST00000599939	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TIMM44-210	ENST00000599939	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TIMM44-210	ENST00000599939	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TIMM44-210	ENST00000599939	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TIMM44-210	ENST00000599939	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TIMM44-210	ENST00000599939		Q9HAA7	133 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TIMM44-210	ENST00000599939	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TIMM44-210	ENST00000599939	SS18	Q15532	418 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TIMM44-210	ENST00000599939		A0A087WYN8	130 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	PAX4	O43316	350 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	LY6G6D	O95868	133 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939		Q8IZM0	81 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	LYRM9	A8MSI8	78 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	DEFB4A	O15263	64 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	ACYP1	P07311	99 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	DEFB135	Q30KP9	77 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	NOTCH2	Q04721	2471 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	MAL	P21145	153 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939		Q8N3U1	123 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TIMM44-210	ENST00000599939	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939		H0YGX0	51 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	DNAL4	O96015	105 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	ATP5G1	P05496	136 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	KIAA0087	Q14695	138 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	INAFM1	C9JVW0	142 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	LECT2	O14960	151 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	CELA1	Q9UNI1	258 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	APOC4	P55056	127 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	DAD1	P61803	113 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TIMM44-210	ENST00000599939	REG3A	Q06141	175 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939		Q8NAQ8	132 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	LINC00643	Q86TS7	51 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	ATR	Q13535	2644 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	CCDC179	H3BU77	68 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	CFAP161	Q6P656	301 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	CXCL5	P42830	114 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	COX17	Q14061	63 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	IMUP	Q9GZP8	106 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	SLPI	P03973	132 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939		B5MCH6	92 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	MIF	P14174	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TIMM44-210	ENST00000599939	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939	NDUFC2	O95298	119 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939	HTN3	P15516	51 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939		Q8NDZ9	215 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939	NCR3	O14931	201 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939	LELP1	Q5T871	98 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939	LINC00167	Q96N53	147 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939	TMEM126A	Q9H061	195 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TIMM44-210	ENST00000599939	C10orf25	Q5T742	122 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	C6orf223	Q8N319	242 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939		Q8N814	137 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	SPAG11B	Q08648	103 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939		A0A1B0GX51	115 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	PRR34	Q9NV39	138 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	KLK12	Q9UKR0	248 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	LINC00846	Q9NV44	126 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	WIPF1	O43516	503 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	C6orf99	Q4VX62	202 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939	ENHO	Q6UWT2	76 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM44-210	ENST00000599939		A0A0J9YWU9	116 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM44-210	ENST00000599939	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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