RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596365.5

LINC00649-208, long intergenic non-protein coding RNA 649, human

TSL 5

Gene LINC00649, Length 682 nt, Biotype antisense RNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00649-208	ENST00000596365	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365		H7C423	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	LTA	P01374	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	PMCH	P20382	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365		A0A1B0GXF2	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365		M0R143	59 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	KRTDAP	P60985	99 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	SS18	Q15532	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365		A8MWL6	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	TRIAP1	O43715	76 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	RAB4A	P20338	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	UBE2B	P63146	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	HBB	P68871	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365		A0A087X002	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	ZNF861P	O60384	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	NCR2	O95944	276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	NTF3	P20783	257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-208	ENST00000596365	COX7A2L	O14548	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	TCAP	O15273	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	HSBP1	O75506	76 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	CTRL	P40313	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365		M0QXV9	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	C20orf202	A1L168	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	TSHB	P01222	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365		A0A1B0GW15	77 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	RIG	Q13278	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365		A0A1B0GUT8	65 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365		F8WDY8	70 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	BATF	Q16520	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365		Q6ZN92	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	G0S2	P27469	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	NDUFA1	O15239	70 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	DLEU1	O43261	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	LINC00614	P0C842	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	MT1H	P80294	61 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00649-208	ENST00000596365	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms