RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584328.1

NF1-223, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 2

Gene NF1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-223	ENST00000584328	ATXN8	Q156A1	80 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TTC32	Q5I0X7	151 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328		Q6ZR54	194 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328		Q8TAT8	98 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	BAALC	Q8WXS3	180 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	SORL1	Q92673	2214 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	SLC25A20	O43772	301 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	NXPH4	O95158	308 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	INS	P01308	110 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	MT-ATP8	P03928	68 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	COX6C	P09669	75 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	RHOH	Q15669	191 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328		Q6ZQT7	251 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	CARD19	Q96LW7	228 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	IMUP	Q9GZP8	106 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	XCL2	Q9UBD3	114 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	IGIP	A6NJ69	53 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328		H3BT86	120 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328		M0R2P5	195 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	LEPROT	O15243	131 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TCL1B	O95988	128 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3-30	P01768	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	ACYP1	P07311	99 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	IFITM1	P13164	125 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	COPS9	Q8WXC6	57 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TMEM126A	Q9H061	195 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328		A0A0U1RRA0	63 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328		H3BVH4	76 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328		J3QQQ9	107 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3-33	P01772	117 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	PRM2	P04554	102 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	ATP5G1	P05496	136 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	CELA1	Q9UNI1	258 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328		A0A0J9YXY3	114 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328		C9JAW5	83 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TIMM17B	O60830	172 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	CRYGD	P07320	174 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	LINC01620	Q4KN68	170 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	C16orf74	Q96GX8	76 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	DNAH2	Q9P225	4427 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NF1-223	ENST00000584328	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	TMEM223	A0PJW6	202 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	LYRM9	A8MSI8	78 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328		A8MU10	97 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	DEFB4A	O15263	64 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	MGP	P08493	103 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	MUC7	Q8TAX7	377 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	PTH2	Q96A98	100 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	UBE2W	Q96B02	151 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	C9orf85	Q96MD7	179 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	LINC01587	Q99440	93 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	KMT2A	Q03164	3969 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		3.51	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.51	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		3.51	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	C3orf84	H3BNL1	204 aa		3.51	□□□□□ -1.85
NF1-223	ENST00000584328	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		3.51	□□□□□ -1.85

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