RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581536.5

TOP3A-211, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-211ENST00000581536 VCX2Q9H322 139 aa6.03□□□□□ -1.44
TOP3A-211ENST00000581536 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
TOP3A-211ENST00000581536 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.03□□□□□ -1.44
TOP3A-211ENST00000581536 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.03□□□□□ -1.44
TOP3A-211ENST00000581536 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.02□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.02□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.02□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 FAM168BA1KXE4 195 aa6.02□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 MT1HL1P0DM35 61 aa6.02□□□□□ -1.45
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TOP3A-211ENST00000581536 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 NDUFA1O15239 70 aa6.01□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 S100PP25815 95 aa6.01□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.01□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 Q6ZRP5 223 aa6.01□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 K7EMI3 77 aa6□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 GAGE2EQ4V326 116 aa6□□□□□ -1.45
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TOP3A-211ENST00000581536 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 C2orf88Q9BSF0 95 aa6□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.99□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 LINC01546A6NGU7 62 aa5.99□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 F8WDY8 70 aa5.99□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.99□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.99□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.99□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.99□□□□□ -1.45
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TOP3A-211ENST00000581536 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.98□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 RHEBQ15382 184 aa5.98□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 ERASQ7Z444 233 aa5.98□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.98□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.98□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 TIMM17AQ99595 171 aa5.98□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.98□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 SCO1O75880 301 aa5.97□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 NPSP0C0P6 89 aa5.97□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 G0S2P27469 103 aa5.97□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.97□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.97□□□□□ -1.45
TOP3A-211ENST00000581536 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.96□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 COX19Q49B96 90 aa5.96□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 FA2HQ7L5A8 372 aa5.96□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.96□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 CST9LQ9H4G1 147 aa5.96□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 A0A096LNJ9 63 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 TRIAP1O43715 76 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 MT-ND6P03923 174 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 PRSS2P07478 247 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 HERVK_113P63121 156 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 PMCHL1Q16048 86 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 LINC01600Q96MT4 127 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.94□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 LINC00614P0C842 121 aa5.94□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 CKS1BP61024 79 aa5.94□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 C1orf137Q5JT78 98 aa5.94□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 Q8IZM0 81 aa5.94□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.93□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.93□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 SNAPINO95295 136 aa5.93□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 SPINK8P0C7L1 97 aa5.93□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 NDUFA6P56556 154 aa5.93□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 KRTAP10-8P60410 259 aa5.93□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 SEC11AP67812 179 aa5.93□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 PMVKQ15126 192 aa5.93□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 SVBPQ8N300 66 aa5.93□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 YPEL4Q96NS1 127 aa5.93□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.92□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.91□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 RAB5BP61020 215 aa5.91□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.91□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 COX7B2Q8TF08 81 aa5.91□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 LINC01549A6NIU2 74 aa5.9□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 F8VRH5 84 aa5.9□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 M0QXV9 152 aa5.9□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 IGLV7-43P04211 117 aa5.9□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 REG3GQ6UW15 175 aa5.9□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 C22orf24Q9Y442 160 aa5.9□□□□□ -1.46
TOP3A-211ENST00000581536 IGLC3P0DOY3 106 aa5.89□□□□□ -1.47
TOP3A-211ENST00000581536 HBDP02042 147 aa5.88□□□□□ -1.47
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
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