RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571937.1

ITGAE-205, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 1,982 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-205ENST00000571937 Q8IZM0 81 aa6.59□□□□□ -1.35
ITGAE-205ENST00000571937 Q9HAA7 133 aa6.59□□□□□ -1.35
ITGAE-205ENST00000571937 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ITGAE-205ENST00000571937 TIMM17BO60830 172 aa6.58□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.58□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 SFTA2Q6UW10 78 aa6.58□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 A0A1B0GV90 55 aa6.58□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 SMIM13P0DJ93 91 aa6.58□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.58□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 LITAFQ99732 161 aa6.58□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 C3orf84H3BNL1 204 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 NPC2P61916 151 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 Q6ZVH6 145 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 DAND5Q8N907 189 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 SPANXCQ9NY87 97 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 CXCL5P42830 114 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 SPAG11BQ08648 103 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 C2orf82Q6UX34 121 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 RAB37Q96AX2 223 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 K7ERJ3 54 aa6.56□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 TAX1BP3O14907 124 aa6.56□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 LINC00158P58513 81 aa6.56□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 KIAA0087Q14695 138 aa6.55□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 COPS9Q8WXC6 57 aa6.55□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 RMI2Q96E14 147 aa6.55□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 A4D1N5 150 aa6.55□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 IFITM1P13164 125 aa6.55□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 PFN2P35080 140 aa6.55□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.55□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 ERG28Q9UKR5 140 aa6.55□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.54□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.54□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 COX11Q9Y6N1 276 aa6.54□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.53□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.53□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 C6orf223Q8N319 242 aa6.53□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.53□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.53□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 KMT2AQ03164 3969 aa6.52□□□□□ -1.36
ITGAE-205ENST00000571937 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 A0A1B0GWB2 263 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 CFC1BP0CG36 223 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 CFC1P0CG37 223 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 C9orf118A6NHY6 69 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 H3BUT2 72 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 COX17Q14061 63 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 C15orf56Q8N910 161 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 LY6G6CO95867 125 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 VAMP3Q15836 100 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 C10orf25Q5T742 122 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 A0A0B4J2C4 111 aa6.49□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.49□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.49□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 PSCAO43653 123 aa6.49□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 TTC32Q5I0X7 151 aa6.49□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 H7C2G1 150 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 C2orf48Q96LS8 159 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 USP17L23D6RBM5 183 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 FABP2P12104 132 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 Q1RN00 199 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 RYR3Q15413 4870 aa6.47□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.47□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 A0A1W2PPM0 123 aa6.47□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 F8WDY8 70 aa6.47□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 TSPAN13O95857 204 aa6.47□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 Q6ZRU5 148 aa6.47□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.47□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 LECT2O14960 151 aa6.46□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.46□□□□□ -1.37
ITGAE-205ENST00000571937 RYR2Q92736 4967 aa6.46□□□□□ -1.38
ITGAE-205ENST00000571937 SYCNQ0VAF6 134 aa6.46□□□□□ -1.38
ITGAE-205ENST00000571937 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGAE-205ENST00000571937 M0R2N4 97 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGAE-205ENST00000571937 PSMB2P49721 201 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGAE-205ENST00000571937 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGAE-205ENST00000571937 GAGE10A6NGK3 116 aa6.44□□□□□ -1.38
ITGAE-205ENST00000571937 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
ITGAE-205ENST00000571937 SVIPQ8NHG7 77 aa6.44□□□□□ -1.38
ITGAE-205ENST00000571937 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.44□□□□□ -1.38
ITGAE-205ENST00000571937 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms