RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568622.1

KIAA0556-208, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 2

Gene KIAA0556, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-208ENST00000568622 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.5□□□□□ -1.37
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KIAA0556-208ENST00000568622 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.49□□□□□ -1.37
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KIAA0556-208ENST00000568622 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.49□□□□□ -1.37
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KIAA0556-208ENST00000568622 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.48□□□□□ -1.37
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KIAA0556-208ENST00000568622 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.48□□□□□ -1.37
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KIAA0556-208ENST00000568622 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.45□□□□□ -1.38
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KIAA0556-208ENST00000568622 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.43□□□□□ -1.38
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KIAA0556-208ENST00000568622 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
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KIAA0556-208ENST00000568622 CDIP1Q9H305 208 aa6.39□□□□□ -1.39
KIAA0556-208ENST00000568622 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.39□□□□□ -1.39
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KIAA0556-208ENST00000568622 IGKV2D-28P01615 120 aa6.36□□□□□ -1.39
KIAA0556-208ENST00000568622 VPREB1P12018 145 aa6.36□□□□□ -1.39
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KIAA0556-208ENST00000568622 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.36□□□□□ -1.39
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM126AQ9H061 195 aa6.36□□□□□ -1.39
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KIAA0556-208ENST00000568622 MT-ND4LP03901 98 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-208ENST00000568622 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.35□□□□□ -1.39
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KIAA0556-208ENST00000568622 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.34□□□□□ -1.39
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KIAA0556-208ENST00000568622 SPINK8P0C7L1 97 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-208ENST00000568622 RAB5BP61020 215 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-208ENST00000568622 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-208ENST00000568622 Q8NDZ9 215 aa6.34□□□□□ -1.39
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KIAA0556-208ENST00000568622 A0A1B0GVG6 124 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 ATP5LO75964 103 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 IGLC3P0DOY3 106 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 PMVKQ15126 192 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 PFN2P35080 140 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 COX17Q14061 63 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 SPRR4Q96PI1 79 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 ERG28Q9UKR5 140 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 H3BRM9 83 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 A0A096LNJ9 63 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
KIAA0556-208ENST00000568622 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.28□□□□□ -1.4
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