RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRIAP1O43715 76 aa4.62□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.62□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 S100PP25815 95 aa4.62□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 G0S2P27469 103 aa4.62□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.62□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 TOMM6Q96B49 74 aa4.62□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 TIMM17AQ99595 171 aa4.62□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.62□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 A0A1W2PNN7 141 aa4.61□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 NDUFA1O15239 70 aa4.61□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 MT-ND6P03923 174 aa4.61□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 MT1HL1P0DM35 61 aa4.61□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 GAGE2BQ13066 116 aa4.61□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.61□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 C10orf25Q5T742 122 aa4.61□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.61□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.61□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 Q6ZN92 141 aa4.61□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.61□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 VCX2Q9H322 139 aa4.61□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.61□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 A0A0J9YXV3 536 aa4.6□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.6□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 LINC01549A6NIU2 74 aa4.6□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 ERASQ7Z444 233 aa4.6□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.6□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.6□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 HERVK_113P63121 156 aa4.59□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 SEC11AP67812 179 aa4.59□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 Q6ZRP5 223 aa4.59□□□□□ -1.67
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 Q8IZM0 81 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 A0A096LNJ9 63 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 C2orf82Q6UX34 121 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 SVBPQ8N300 66 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 SNAPINO95295 136 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 APOC3P02656 99 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 FA2HQ7L5A8 372 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 LINC01600Q96MT4 127 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 YPEL4Q96NS1 127 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 CST9LQ9H4G1 147 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.56□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM168BA1KXE4 195 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRSS2P07478 247 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 CXCL5P42830 114 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 PMVKQ15126 192 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 NDUFA5Q16718 116 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 GAGE2EQ4V326 116 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 F8VRH5 84 aa4.54□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 LINC00614P0C842 121 aa4.54□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 KRTAP10-8P60410 259 aa4.54□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 CKS1BP61024 79 aa4.54□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.54□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.54□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.54□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.54□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.54□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGLC3P0DOY3 106 aa4.53□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 REG3GQ6UW15 175 aa4.53□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.52□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 M0QXV9 152 aa4.52□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 HBDP02042 147 aa4.52□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGLV7-43P04211 117 aa4.52□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 RAB5BP61020 215 aa4.52□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 C1orf137Q5JT78 98 aa4.52□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 COX7B2Q8TF08 81 aa4.52□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 ATP5LO75964 103 aa4.51□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 SPINK8P0C7L1 97 aa4.51□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.51□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 H3BRM9 83 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 PMCHL1Q16048 86 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP4-201ENST00000561405 C22orf24Q9Y442 160 aa4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms