RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	C3orf79	P0CE67	100 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	S100A12	P80511	92 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	ENHO	Q6UWT2	76 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZUT4	128 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	BAALC	Q8WXS3	180 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM141	Q96I45	108 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	AMELX	Q99217	191 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	TIMM17A	Q99595	171 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	UPK3B	Q9BT76	320 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	VCX2	Q9H322	139 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	KLK12	Q9UKR0	248 aa		2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GWB2	263 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	LINC01549	A6NIU2	74 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934		H0Y9J4	135 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP12-2	P59991	146 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	KRTDAP	P60985	99 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	COX6A2	Q02221	97 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	PMVK	Q15126	192 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM101	Q96IK0	257 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0J9YXV3	536 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934		H0Y8G0	127 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934		M0R2N4	97 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	LY6G6C	O95867	125 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2D1	P51668	147 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	REG3A	Q06141	175 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZN92	141 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2W	Q96B02	151 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0J9YXY3	114 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	C11orf86	A6NJI1	115 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00587	B1AMM8	73 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	PKIA	P61925	76 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	LINC01545	Q5VT33	79 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	C7orf33	Q8WU49	177 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	PRO1933	Q9H354	126 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	TG	P01266	2768 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934		F8VRH5	84 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	PANO1	I0J062	215 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	CCL25	O15444	150 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	IGLC3	P0DOY3	106 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	XCL1	P47992	114 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	SS18	Q15532	418 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	MIA	Q16674	131 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	MAJIN	Q3KP22	176 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	C5orf38	Q86SI9	138 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	ATOH7	Q8N100	152 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	C20orf202	A1L168	122 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	TSTD3	H0UI37	97 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934		K7EP13	123 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF861P	O60384	105 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	DPM2	O94777	84 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	IGKC	P01834	107 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	CRP	P02741	224 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	DDT	P30046	118 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	VAMP8	Q9BV40	100 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
LINS1-210	ENST00000560934	TENM2	Q9NT68	2774 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		2.83	□□□□□ -1.96

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