RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560350.5

USP3-AS1-206, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 407 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-206ENST00000560350 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.8□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.8□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 C7orf33Q8WU49 177 aa4.8□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.8□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.8□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.8□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 NDUFA1O15239 70 aa4.79□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 HERVK_113P63121 156 aa4.79□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 SPAG11BQ08648 103 aa4.79□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 MAJINQ3KP22 176 aa4.79□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.79□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 LINC00614P0C842 121 aa4.78□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 Q6ZRU5 148 aa4.78□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 STPG4Q8N801 248 aa4.78□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 PANO1I0J062 215 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 OXTP01178 125 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 PRSS2P07478 247 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 S100A1P23297 94 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 A0A096LNI7 61 aa4.76□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.76□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 CHTF8P0CG12 524 aa4.76□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 CXCL5P42830 114 aa4.76□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 GAGE2BQ13066 116 aa4.76□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 KIAA0087Q14695 138 aa4.76□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 PMVKQ15126 192 aa4.76□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.76□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 Q8IZM0 81 aa4.76□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 ATP5LO75964 103 aa4.75□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 CKS1BP61024 79 aa4.75□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.75□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.75□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 CST9LQ9H4G1 147 aa4.75□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 H3BRM9 83 aa4.74□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 HBDP02042 147 aa4.74□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.74□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.74□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 Q6ZRP5 223 aa4.74□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.74□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.74□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 A0A0J9YXV3 536 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 FAT1Q14517 4588 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 F8VRH5 84 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 SFTA2Q6UW10 78 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 YPEL4Q96NS1 127 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-206ENST00000560350 A0A1W2PNN7 141 aa4.71□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGLC3P0DOY3 106 aa4.71□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 NDUFA6P56556 154 aa4.71□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.71□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 HSBP1O75506 76 aa4.7□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 GAGE2EQ4V326 116 aa4.7□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 C2orf82Q6UX34 121 aa4.7□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 BAGE3Q86Y29 109 aa4.7□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 COX7B2Q8TF08 81 aa4.7□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.7□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.7□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 A0A096LNJ9 63 aa4.69□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.69□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.69□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.68□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRGC2P03986 189 aa4.68□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.68□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 REG3GQ6UW15 175 aa4.68□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.68□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.68□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 SPINK8P0C7L1 97 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 COX17Q14061 63 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 LCE1EQ5T753 118 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 COLCA2A8K830 154 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 LINC00587B1AMM8 73 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 LEPROTL1O95214 131 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-206ENST00000560350 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms