RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843		A0A087WVE0	104 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843		D6R8Y8	96 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843		K7EP34	96 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	LEPROTL1	O95214	131 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	CYB5A	P00167	134 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	GNGT1	P63211	74 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	HMGN3	Q15651	99 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	TDRG1	Q3Y452	100 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	S100A13	Q99584	98 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	CNFN	Q9BYD5	112 aa		0.28	□□□□□ -2.36
COPS2-205	ENST00000558843	CEP162	Q5TB80	1403 aa		0.28	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	CUX1	P39880	1505 aa		0.28	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		0.28	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	KIAA0556	O60303	1618 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	LRP6	O75581	1613 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843		F8WEM9	126 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843		H0Y9P7	68 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	BCE1	O60756	84 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ACYP1	P07311	99 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PLGLA	Q15195	96 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ADIRF	Q15847	76 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	LINC00846	Q9NV44	126 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PRO0255	Q9UI72	69 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	MED14	O60244	1454 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	NLRP1	Q9C000	1473 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	TTC28	Q96AY4	2481 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	LAMC1	P11047	1609 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ALK	Q9UM73	1620 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	LTN1	O94822	1766 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	RGPD5	Q99666	1765 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	TSC2	P49815	1807 aa		0.27	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	KMT2D	O14686	5537 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843		A0A1B0GU69	56 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	COX8A	P10176	69 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843		Q8IZM0	81 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	USMG5	Q96IX5	58 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	LINC01600	Q96MT4	127 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SPRR4	Q96PI1	79 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	DIP2B	Q9P265	1576 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	PAPPA	Q13219	1627 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	TNC	P24821	2201 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	USF3	Q68DE3	2245 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	USP24	Q9UPU5	2620 aa		0.26	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ABCC1	P33527	1531 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843		A0A1B0GUT8	65 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	NDUFB1	O75438	58 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	WFDC2	Q14508	124 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	NMS	Q5H8A3	153 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		0.25	□□□□□ -2.37
COPS2-205	ENST00000558843	LINC00643	Q86TS7	51 aa		0.25	□□□□□ -2.37

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