RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATL1-208	ENST00000556067	HIGD1B	Q9P298	99 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATL1-208	ENST00000556067	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067		A0A087WZ39	114 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM238	C9JI98	176 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	CKS1B	P61024	79 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	HERV-K104	P63124	156 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	HSD52	Q0P140	79 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	BATF	Q16520	125 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	TAL2	Q16559	108 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	C5orf38	Q86SI9	138 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	COPS9	Q8WXC6	57 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	UPK3B	Q9BT76	320 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067		A6NDN8	102 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	ENHO	Q6UWT2	76 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067		Q9H8V8	135 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	APLN	Q9ULZ1	77 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	NDUFA1	O15239	70 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	CXCL5	P42830	114 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	TTC32	Q5I0X7	151 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067		Q6ZVH6	145 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067		Q8IZM0	81 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	TM2D2	Q9BX73	214 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067		Q9HAA7	133 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067		A0A0J9YXY3	114 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	PSCA	O43653	123 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	TIMM17B	O60830	172 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	MUC7	Q8TAX7	377 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	TENM3	Q9P273	2699 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	DNHD1	Q96M86	4753 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	SMIM13	P0DJ93	91 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	IFITM1	P13164	125 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	LINC00158	P58513	81 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	SPAG11B	Q08648	103 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	CEND1	Q8N111	149 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067		F8WDY8	70 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATL1-208	ENST00000556067		A0A0U1RRA0	63 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	C3orf84	H3BNL1	204 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	PFN2	P35080	140 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	COX17	Q14061	63 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	RAB37	Q96AX2	223 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	SPANXC	Q9NY87	97 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	ERG28	Q9UKR5	140 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	IGKV2-30	P06310	120 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	C14orf177	Q52M58	125 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	C2orf82	Q6UX34	121 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	C2orf48	Q96LS8	159 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	USP17L23	D6RBM5	183 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	FXYD2	P54710	66 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	NPC2	P61916	151 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	SYCN	Q0VAF6	134 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	KIAA0087	Q14695	138 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067		A4D1N5	150 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	LY6G6C	O95867	125 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067		Q1RN00	199 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ATL1-208	ENST00000556067	C6orf223	Q8N319	242 aa		3.68	□□□□□ -1.82

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