RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 SEC11AP67812 179 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-231ENST00000552222 A0A087WZ39 114 aa8.83□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 A0A0J9YXV3 536 aa8.83□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 hDV102S1A0JD36 115 aa8.83□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.83□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.82□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 LEPROTL1O95214 131 aa8.82□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 C3orf79P0CE67 100 aa8.82□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 HERVK_113P63121 156 aa8.82□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.82□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.82□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 PANO1I0J062 215 aa8.81□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 APOMO95445 188 aa8.81□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 SCGB1D1O95968 90 aa8.81□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 SLPIP03973 132 aa8.81□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 KRTDAPP60985 99 aa8.81□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.81□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.8□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.8□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.8□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.8□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.79□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 IGLC3P0DOY3 106 aa8.79□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.78□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 S100A12P80511 92 aa8.78□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 PET117Q6UWS5 81 aa8.78□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.78□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.78□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.78□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.78□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-231ENST00000552222 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 SPAG11BQ08648 103 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 C20orf202A1L168 122 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 C11orf86A6NJI1 115 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 C2orf48Q96LS8 159 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 F8VRH5 84 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 KIAA0087Q14695 138 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 Q6ZRU5 148 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 F8WDY8 70 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 H0Y8G0 127 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 H3BRM9 83 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 SYCNQ0VAF6 134 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 LINC01545Q5VT33 79 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 SPINK8P0C7L1 97 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 CARD19Q96LW7 228 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 Q8IZM0 81 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 VAMP8Q9BV40 100 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 MUC2Q02817 5179 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-231ENST00000552222 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 TSTD3H0UI37 97 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 NDUFA1O15239 70 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 PRSS2P07478 247 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 C10orf25Q5T742 122 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 PLNP26678 52 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 RNF151Q2KHN1 245 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 C2orf82Q6UX34 121 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 COX7B2Q8TF08 81 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 TMEM223A0PJW6 202 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 DPM2O94777 84 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 CKS1BP61024 79 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 CXCL5P42830 114 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 IGKCP01834 107 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 SPATA45Q537H7 98 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 ATOH7Q8N100 152 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 LINC01600Q96MT4 127 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 PRO1933Q9H354 126 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-231ENST00000552222 A0A096LNI7 61 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 CHTF8P0CG12 524 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 DDTP30046 118 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 KRTAP10-8P60410 259 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 MAJINQ3KP22 176 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-231ENST00000552222 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.62□□□□□ -1.03
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