RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549400.1

PTPRB-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRB, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-207ENST00000549400 ICOSQ9Y6W8 199 aa2.78□□□□□ -1.96
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PTPRB-207ENST00000549400 LEPROTO15243 131 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRB-207ENST00000549400 IGHV4-59P01825 116 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRB-207ENST00000549400 DEFB113Q30KQ7 82 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRB-207ENST00000549400 DEFB112Q30KQ8 113 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRB-207ENST00000549400 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa2.72□□□□□ -1.97
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