RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-206ENST00000548122 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-206ENST00000548122 PATE2Q6UY27 113 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-206ENST00000548122 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-206ENST00000548122 C16orf74Q96GX8 76 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-206ENST00000548122 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-206ENST00000548122 PLNP26678 52 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRB-206ENST00000548122 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-206ENST00000548122 PRR15LQ9BU68 103 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-206ENST00000548122 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-206ENST00000548122 A0A0J9YY99 117 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRB-206ENST00000548122 Q8N1Y9 231 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-206ENST00000548122 DCANP1Q8TF63 244 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-206ENST00000548122 C3orf84H3BNL1 204 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-206ENST00000548122 NFE4Q86UQ8 179 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-206ENST00000548122 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
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PTPRB-206ENST00000548122 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRB-206ENST00000548122 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 MDFICQ9P1T7 246 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 NACAE9PAV3 2078 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 A0A1B0GXF2 115 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 MED14OSP0DP75 135 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 Q5XG85 94 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 CARD19Q96LW7 228 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 ESRGQ1W209 222 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 PRAC2D3DTV9 90 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 HIGD1BQ9P298 99 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 ODF3Q96PU9 254 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 PSCAO43653 123 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRB-206ENST00000548122 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 A0A096LPF7 62 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRB-206ENST00000548122 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRB-206ENST00000548122 F8VRH5 84 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRB-206ENST00000548122 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRB-206ENST00000548122 PRAC1Q96KF2 57 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRB-206ENST00000548122 M0R2N4 97 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRB-206ENST00000548122 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 FHL2Q14192 279 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 TMEM141Q96I45 108 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRB-206ENST00000548122 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRB-206ENST00000548122 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRB-206ENST00000548122 hDV103S1A0JD37 113 aa3.97□□□□□ -1.77
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PTPRB-206ENST00000548122 CFC1P0CG37 223 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 GNRH2O43555 120 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRB-206ENST00000548122 Q6ZTI0 123 aa3.97□□□□□ -1.77
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PTPRB-206ENST00000548122 CFAP126Q5VTH2 177 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRB-206ENST00000548122 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRB-206ENST00000548122 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRB-206ENST00000548122 LST1O00453 97 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRB-206ENST00000548122 DPH3Q96FX2 82 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRB-206ENST00000548122 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRB-206ENST00000548122 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRB-206ENST00000548122 I3L3M4 83 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRB-206ENST00000548122 CRYGAP11844 174 aa3.96□□□□□ -1.78
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