RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540115.1

ACSL3-210, Transcript of acyl-CoA synthetase long chain family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene ACSL3, Length 624 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3-210ENST00000540115 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 FA2HQ7L5A8 372 aa6.26□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 ERASQ7Z444 233 aa6.26□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 TOMM6Q96B49 74 aa6.26□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.26□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 A0A0J9YXV3 536 aa6.25□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.25□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.25□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 REG3GQ6UW15 175 aa6.25□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.25□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.24□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.24□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.24□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.24□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 A0A1W2PNN7 141 aa6.23□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 SNAPINO95295 136 aa6.23□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 CXCL5P42830 114 aa6.23□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 GAGE2EQ4V326 116 aa6.23□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 LCE4AQ5TA78 99 aa6.23□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.23□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.23□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.22□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 KIAA0087Q14695 138 aa6.22□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 C10orf25Q5T742 122 aa6.22□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.22□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 Q8IZM0 81 aa6.22□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 SVBPQ8N300 66 aa6.22□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.22□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.22□□□□□ -1.41
ACSL3-210ENST00000540115 LINC01546A6NGU7 62 aa6.21□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 APOC3P02656 99 aa6.21□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 RAB5BP61020 215 aa6.21□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.21□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.21□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.2□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 H3BRM9 83 aa6.2□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 UBE2BP63146 152 aa6.2□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 PMVKQ15126 192 aa6.2□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 C2orf82Q6UX34 121 aa6.2□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.2□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.2□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.2□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 F8VRH5 84 aa6.19□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.19□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 C1orf137Q5JT78 98 aa6.19□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 LINC01600Q96MT4 127 aa6.19□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.19□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.19□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 M0QXV9 152 aa6.18□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 LINC00614P0C842 121 aa6.18□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 NDUFA6P56556 154 aa6.18□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 CST9LQ9H4G1 147 aa6.18□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 ATP5LO75964 103 aa6.17□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 HBDP02042 147 aa6.17□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 COX7B2Q8TF08 81 aa6.17□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 DIRC1Q969H9 104 aa6.17□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.16□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.16□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 FAM168BA1KXE4 195 aa6.15□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 IGLV7-43P04211 117 aa6.15□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 MT1HL1P0DM35 61 aa6.15□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 ODF1Q14990 250 aa6.15□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.15□□□□□ -1.42
ACSL3-210ENST00000540115 SPINK8P0C7L1 97 aa6.14□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 NUPR1O60356 82 aa6.13□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 IGLC3P0DOY3 106 aa6.13□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 SFTA2Q6UW10 78 aa6.13□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.13□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.13□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 BAGE3Q86Y29 109 aa6.12□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 C22orf24Q9Y442 160 aa6.12□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.11□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.11□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.11□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 H0Y9J4 135 aa6.1□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 H3BS24 57 aa6.1□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 KRTAP10-8P60410 259 aa6.1□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 PMCHL1Q16048 86 aa6.1□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 A0A096LNJ9 63 aa6.09□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.09□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 HSBP1O75506 76 aa6.09□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 COX17Q14061 63 aa6.09□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.09□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.09□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ACSL3-210ENST00000540115 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.08□□□□□ -1.44
ACSL3-210ENST00000540115 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.08□□□□□ -1.44
ACSL3-210ENST00000540115 ZNF861PO60384 105 aa6.08□□□□□ -1.44
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