RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 FAM104AQ969W3 186 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 LINC01546A6NGU7 62 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRU-210ENST00000527027 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
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PTPRU-210ENST00000527027 M0QXV9 152 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRU-210ENST00000527027 FABP4P15090 132 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-210ENST00000527027 AKR1D1P51857 326 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-210ENST00000527027 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-210ENST00000527027 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRU-210ENST00000527027 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRU-210ENST00000527027 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.43□□□□□ -0.9
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