RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.02□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 ACANP16112 2415 aa6.02□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 K7EQG2 157 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 Q9H8V8 135 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 SLURP1P55000 103 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 PAX4O43316 350 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 MTORP42345 2549 aa6□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 ITPR2Q14571 2701 aa6□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 H0YGX0 51 aa6□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 MIFP14174 115 aa5.99□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.99□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 CRPP02741 224 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 ESRGQ1W209 222 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 UBL5Q9BZL1 73 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 LECT2O14960 151 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 IGKV2D-28P01615 120 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 C2CD3Q4AC94 2353 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 HTN1P15515 57 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.96□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 DEFB131AP59861 70 aa5.96□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 PDZD2O15018 2839 aa5.96□□□□□ -1.45
TRPS1-209ENST00000519674 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00167Q96N53 147 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 C6orf223Q8N319 242 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 SLPIP03973 132 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 PRM2P04554 102 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 COX6A2Q02221 97 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 JMJD1CQ15652 2540 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 ERC2-IT1O76042 136 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZTC4 211 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 ESM1Q9NQ30 184 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 Q1T7F1 81 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 A0A087WZ39 114 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 DAD1P61803 113 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZTI0 123 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 CXCL6P80162 114 aa5.91□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.91□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 Q8N3U1 123 aa5.91□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00467Q9BRT7 94 aa5.91□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.9□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 NOTCH2Q04721 2471 aa5.9□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 PROK1P58294 105 aa5.9□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZRP5 223 aa5.9□□□□□ -1.46
TRPS1-209ENST00000519674 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.9□□□□□ -1.47
TRPS1-209ENST00000519674 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.9□□□□□ -1.47
TRPS1-209ENST00000519674 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
TRPS1-209ENST00000519674 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
TRPS1-209ENST00000519674 A8MTW9 85 aa5.89□□□□□ -1.47
TRPS1-209ENST00000519674 LY6G6DO95868 133 aa5.89□□□□□ -1.47
TRPS1-209ENST00000519674 NREPQ16612 68 aa5.89□□□□□ -1.47
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZQT0 140 aa5.89□□□□□ -1.47
TRPS1-209ENST00000519674 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.89□□□□□ -1.47
TRPS1-209ENST00000519674 CCL24O00175 119 aa5.89□□□□□ -1.47
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