RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 DNAH6Q9C0G6 4158 aa10.26□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 TAX1BP3O14907 124 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 A0A0U1RRA0 63 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 OCIAD2Q56VL3 154 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 COX7B2Q8TF08 81 aa10.25□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 KIAA0087Q14695 138 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 SLC25A34Q6PIV7 304 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 Q6ZR54 194 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 NDUFA12Q9UI09 145 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 C10orf25Q5T742 122 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 BOD1L2Q8IYS8 172 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 VPS25Q9BRG1 176 aa10.24□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10.23□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 USP17L23D6RBM5 183 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 PSCAO43653 123 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 SPAG11BQ08648 103 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 C2orf91Q6ZV80 131 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 C6orf226Q5I0X4 101 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 TTC32Q5I0X7 151 aa10.22□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa10.21□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 DAND5Q8N907 189 aa10.21□□□□□ -0.77
TRPS1-206ENST00000517323 RYR2Q92736 4967 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 DNAH17Q9UFH2 4485 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 K7ERU9 68 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 PRSS2P07478 247 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 SCGB1D4Q6XE38 83 aa10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 SLPIP03973 132 aa10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 FAT2Q9NYQ8 4349 aa10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 A0A0J9YXY3 114 aa10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 NPC2P61916 151 aa10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 Q8IZM0 81 aa10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 RMI2Q96E14 147 aa10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 NDUFA1O15239 70 aa10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 CFAP161Q6P656 301 aa10.18□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 APOMO95445 188 aa10.17□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 CKS1BP61024 79 aa10.17□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 RYR3Q15413 4870 aa10.17□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa10.16□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 PFN2P35080 140 aa10.16□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 SMIM13P0DJ93 91 aa10.15□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 Q6ZRU5 148 aa10.15□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TRPS1-206ENST00000517323 LRCOL1A6NCL2 159 aa10.15□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 LINC01620Q4KN68 170 aa10.15□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 C1orf134Q5TEV5 83 aa10.15□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 LINC01561Q8N1V8 128 aa10.15□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 TM2D2Q9BX73 214 aa10.15□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 CAMK2N2Q96S95 79 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 LITAFQ99732 161 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 MEIG1Q5JSS6 88 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 C6orf48Q9UBA6 75 aa10.14□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 LCE6AA0A183 80 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 DNAH11Q96DT5 4516 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 PKD1P98161 4303 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 GAGE10A6NGK3 116 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 RTL8CO15255 209 aa10.11□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 TNP2Q05952 138 aa10.11□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 ERG28Q9UKR5 140 aa10.1□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00158P58513 81 aa10.09□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 A6NDN8 102 aa10.09□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM238C9JI98 176 aa10.09□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 HIST1H4GQ99525 98 aa10.09□□□□□ -0.79
TRPS1-206ENST00000517323 PKHD1P08F94 4074 aa10.08□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 A0A087WTM6 91 aa10.08□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 C9orf118A6NHY6 69 aa10.08□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 SYCNQ0VAF6 134 aa10.08□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa10.08□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa10.08□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 GCSHP23434 173 aa10.07□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 HERV-K104P63124 156 aa10.07□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 K7EP34 96 aa10.06□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 FXYD2P54710 66 aa10.06□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 CARD19Q96LW7 228 aa10.06□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 XAGE1AQ9HD64 81 aa10.06□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 HIGD1BQ9P298 99 aa10.06□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 DNAH5Q8TE73 4624 aa10.06□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 CXCL5P42830 114 aa10.05□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 MUSTN1Q8IVN3 82 aa10.05□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 Q8N814 137 aa10.05□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 HSD52Q0P140 79 aa10.05□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 C2orf48Q96LS8 159 aa10.05□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 GAGE2EQ4V326 116 aa10.04□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 Q6ZRP5 223 aa10.04□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 GAGE2DQ9UEU5 116 aa10.04□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 Q8NDZ9 215 aa10.04□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 H3BUT2 72 aa10.02□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
TRPS1-206ENST00000517323 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms