RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFP1Q6P2D0 407 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEX261Q6UWH6 196 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q6ZN92 141 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 PQLC2Q6ZP29 291 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q6ZUT4 128 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 STX12Q86Y82 276 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 SAMD12Q8N8I0 201 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRRT1Q99946 306 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 NPCDR1Q9BY65 106 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 MCUBQ9NWR8 336 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFP30Q9Y2G7 519 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 XKRY2A2RUG3 117 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 A8MUU9 505 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 H0YAA0 97 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 CXCL1P09341 107 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB5AP20339 215 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 SDC2P34741 201 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRIP1P50238 77 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKR1D1P51857 326 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP12-4P60329 112 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 ID3Q02535 119 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP6V1FQ16864 119 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1orf146Q5VVC0 180 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAAP20Q6NZ36 180 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 PP632Q6XCG6 107 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRR15Q8IV56 129 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q8IZM0 81 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLAC4Q8WY50 150 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 ST20Q9HBF5 79 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 EPDR1Q9UM22 224 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGSF23A1L1A6 192 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 C7orf66A4D0T2 115 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP5LO75964 103 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKAIN1P0CW23 69 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 VPREB1P12018 145 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDE6GP18545 87 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFA6P56556 154 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP10-12P60413 245 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 TWIST1Q15672 202 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM128Q5BJH2 165 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 MZT2BQ6NZ67 158 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 LCA10Q71F78 164 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMUB2Q71RG4 321 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 FA2HQ7L5A8 372 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 WFDC13Q8IUB5 93 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC01561Q8N1V8 128 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM229BQ8NBD8 167 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 THAP6Q8TBB0 222 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 FMC1Q96HJ9 113 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 LITAFQ99732 161 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q9BRP9 147 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 C2orf88Q9BSF0 95 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTFP1Q9UDX5 166 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB26Q9ULW5 256 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 TPRKBQ9Y3C4 175 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM25AB3EWG3 89 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM25CB3EWG5 89 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM25GB3EWG6 89 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 F2Z2F3 143 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 PEX7O00628 323 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 VCYO14598 125 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP5HO75947 161 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNAO1P09471 354 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 PFN2P35080 140 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF345Q14585 488 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALKAL2Q6UX46 152 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H2BAQ96A08 127 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM191AQ9H0A3 160 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 VCX3BQ9H321 246 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 VCX3AQ9NNX9 186 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM167BQ9NRX6 74 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 C5orf52A6NGY3 159 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 B5MCH6 92 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 APOA1P02647 267 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKR1C3P42330 323 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL35P42766 123 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 MT1XP80297 61 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 NHLH2Q02577 135 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLKP1Q107X0 134 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms