RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 GNGT2O14610 69 aa2.44□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 UQCRQO14949 82 aa2.44□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 PPYP01298 95 aa2.44□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHV3-33P01772 117 aa2.44□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 PLGLAQ15195 96 aa2.44□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 CASC2Q6XLA1 102 aa2.44□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 TCTE3Q8IZS6 198 aa2.44□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 CMC2Q9NRP2 79 aa2.44□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 PKHD1P08F94 4074 aa2.43□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 H3BUA1 57 aa2.43□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 LSM3P62310 102 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM244Q5VVB8 128 aa2.43□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A26Q70HW3 274 aa2.43□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 DYNLRB2Q8TF09 96 aa2.43□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 STARD9Q9P2P6 4700 aa2.42□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa2.42□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 EDF1O60869 148 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 TCRAP04437 139 aa2.42□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 GYPBP06028 91 aa2.42□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS27P42677 84 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 USMG5Q96IX5 58 aa2.42□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 WFDC10AQ9H1F0 79 aa2.42□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 R4GMQ9 66 aa2.42□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 V9GYS6 101 aa2.42□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 MUC2Q02817 5179 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 KMT2AQ03164 3969 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 FXYD1O00168 92 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 SULT1C4O75897 302 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 OR2H2O95918 312 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 FXYD6P3P58550 94 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 TPPP2P59282 170 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP3R1P63098 170 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 DEFB136Q30KP8 78 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 GSKIPQ9P0R6 139 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 ABRACLQ9P1F3 81 aa2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-205ENST00000514178 MCRIP1C9JLW8 97 aa2.4□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 IGLV3-1P01715 115 aa2.4□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 COX4I1P13073 169 aa2.4□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 NEDD8Q15843 81 aa2.4□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 HSD17B12Q53GQ0 312 aa2.4□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC01590Q5TEZ4 76 aa2.4□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa2.4□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 C10orf99Q6UWK7 81 aa2.4□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 MYOZ3Q8TDC0 251 aa2.4□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ARL11Q969Q4 196 aa2.4□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 SAR1AQ9NR31 198 aa2.4□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.39□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM223BA6NKX1 122 aa2.39□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 TFF1P04155 84 aa2.39□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF137PP52743 207 aa2.39□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.39□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 MAFIPQ8WZ33 124 aa2.39□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 HSPB8Q9UJY1 196 aa2.39□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.39□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 YPEL1O60688 119 aa2.38□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 NDUFA3O95167 84 aa2.38□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 MORN2Q502X0 79 aa2.38□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 Q8N6K4 173 aa2.38□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 C5orf17Q8NAS9 161 aa2.38□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 GNG8Q9UK08 70 aa2.38□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 HSPG2P98160 4391 aa2.37□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 IFNA17P01571 189 aa2.37□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ETV6P41212 452 aa2.37□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 FXYD3Q14802 87 aa2.37□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 VSTM2AQ8TAG5 236 aa2.37□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 AP1S3Q96PC3 154 aa2.37□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 AMELYQ99218 206 aa2.37□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 COA4Q9NYJ1 87 aa2.37□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.36□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 A6NIN4 97 aa2.36□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 G3V318 75 aa2.36□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 CKS1BP61024 79 aa2.36□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 DEFB107AQ8IZN7 70 aa2.36□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ACBD7Q8N6N7 88 aa2.36□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 LEAP2Q969E1 77 aa2.36□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 LIMD2Q9BT23 127 aa2.36□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF213Q63HN8 5207 aa2.36□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa2.35□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ARPC4P59998 168 aa2.35□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 DEFB114Q30KQ6 69 aa2.35□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC58Q4VC31 144 aa2.35□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 IZUMO2Q6UXV1 221 aa2.35□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00299Q6ZSB3 139 aa2.35□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa2.35□□□□□ -2.03
PGGT1B-205ENST00000514178 TTTY10Q9BZA0 68 aa2.35□□□□□ -2.03
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