RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508238.5

UBE2D3-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 D3, human

TSL 4

Gene UBE2D3, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2D3-222	ENST00000508238	NDUFA1	O15239	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238		A0A087WZ39	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	SNAPIN	O95295	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	PRSS2	P07478	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238		Q6ZRP5	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238		A0A1W2PNN7	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	RAB5B	P61020	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	HERVK_113	P63121	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	IFITM2	Q01629	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	SVBP	Q8N300	66 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	TNXB	P22105	4242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	UBE2D1	P51668	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	CKS1B	P61024	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	AMELX	Q99217	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2D3-222	ENST00000508238		A0A0J9YXV3	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	APOC3	P02656	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	CXCL5	P42830	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238		A0A0A0MQY5	61 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238		H3BRM9	83 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	LINC00614	P0C842	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	PMVK	Q15126	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238		Q8IZM0	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	ATP5L	O75964	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238		F8VRH5	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	NDUFA6	P56556	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE2D3-222	ENST00000508238	HBD	P02042	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBE2D3-222	ENST00000508238	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBE2D3-222	ENST00000508238	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBE2D3-222	ENST00000508238	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBE2D3-222	ENST00000508238	LRP2	P98164	4655 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE2D3-222	ENST00000508238	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE2D3-222	ENST00000508238		M0QXV9	152 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBE2D3-222	ENST00000508238	UBE2B	P63146	152 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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