RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-215ENST00000494945 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 LINC00587B1AMM8 73 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 HSD52Q0P140 79 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 Q6ZR54 194 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 PSCAO43653 123 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 C2orf48Q96LS8 159 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 USP17L23D6RBM5 183 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 M0R143 59 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 C2orf82Q6UX34 121 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 Q6ZVH6 145 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 HIST1H4GQ99525 98 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 LITAFQ99732 161 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-215ENST00000494945 M0R2N4 97 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 C6orf223Q8N319 242 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 SPANXCQ9NY87 97 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 ERG28Q9UKR5 140 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 COX17Q14061 63 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 C14orf177Q52M58 125 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 SMIM13P0DJ93 91 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 CEND1Q8N111 149 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 COPS9Q8WXC6 57 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 IFITM1P13164 125 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 GCSHP23434 173 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 LINC00158P58513 81 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 SYCNQ0VAF6 134 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 C10orf25Q5T742 122 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 LECT2O14960 151 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 PFN2P35080 140 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 PTTG1IPP53801 180 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 RNF151Q2KHN1 245 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 Q6ZRU5 148 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 A0A0U1RRA0 63 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 A6NJY4 79 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 WFDC2Q14508 124 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 CARD19Q96LW7 228 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-215ENST00000494945 FXYD2P54710 66 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 BATFQ16520 125 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 DAND5Q8N907 189 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 KMT2AQ03164 3969 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 A6NDN8 102 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 EREGO14944 169 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 LCE6AA0A183 80 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 SLPIP03973 132 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 A4D1N5 150 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 NPC2P61916 151 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 A0A087WTM6 91 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 A0A1B0GWB2 263 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 Q8N814 137 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 DNAH2Q9P225 4427 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 A0A0B4J2C4 111 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-215ENST00000494945 NDUFC2O95298 119 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 CFC1BP0CG36 223 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 CFC1P0CG37 223 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 Q6ZRP5 223 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 RTL8CO15255 209 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-215ENST00000494945 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.13□□□□□ -1.27
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