RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 KIAA0087Q14695 138 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 J3QQQ9 107 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 NDUFA1O15239 70 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 HERV-K104P63124 156 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 RNF151Q2KHN1 245 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 ATOH7Q8N100 152 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 STPG4Q8N801 248 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 Q8N814 137 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 VAMP8Q9BV40 100 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 C16orf90A8MZG2 172 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 LINC00587B1AMM8 73 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 S100A12P80511 92 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 TNP2Q05952 138 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 SYCNQ0VAF6 134 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.65□□□□□ -1.18
NISCH-211ENST00000488243 LECT2O14960 151 aa7.64□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 CDK2AP2O75956 126 aa7.64□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 WFDC2Q14508 124 aa7.64□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.64□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.64□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.63□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 COX17Q14061 63 aa7.63□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.63□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 CARD19Q96LW7 228 aa7.63□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 SPATA45Q537H7 98 aa7.62□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 Q8N1X5 172 aa7.62□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 DLEU1O43261 78 aa7.61□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.61□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.61□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.6□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 ZNF815PA8K554 130 aa7.6□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.6□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 COX8AP10176 69 aa7.6□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 GCSHP23434 173 aa7.6□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.6□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 MAJINQ3KP22 176 aa7.6□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.6□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZRU5 148 aa7.6□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 TIMM17BO60830 172 aa7.59□□□□□ -1.19
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NISCH-211ENST00000488243 C2orf82Q6UX34 121 aa7.59□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.59□□□□□ -1.19
NISCH-211ENST00000488243 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.58□□□□□ -1.2
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NISCH-211ENST00000488243 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.58□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.58□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 ERG28Q9UKR5 140 aa7.58□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.57□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.57□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.57□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 C10orf25Q5T742 122 aa7.57□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.57□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.57□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 A0A0J9YXY3 114 aa7.56□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.56□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZVH6 145 aa7.56□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 PCP2Q8IVA1 136 aa7.56□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 COPS9Q8WXC6 57 aa7.56□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 C12orf57Q99622 126 aa7.56□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 TMEM238C9JI98 176 aa7.55□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 LINC00158P58513 81 aa7.54□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.54□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.54□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 C14orf144Q96I85 54 aa7.54□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.54□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 HIGD1BQ9P298 99 aa7.54□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.54□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 PFN2P35080 140 aa7.53□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP10-2P60368 255 aa7.53□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.53□□□□□ -1.2
NISCH-211ENST00000488243 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 SMIM13P0DJ93 91 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 IFITM1P13164 125 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 PTTG1IPP53801 180 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 SPANXCQ9NY87 97 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 EPM2AB3EWF7 344 aa7.51□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 TSTD3H0UI37 97 aa7.51□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZRP5 223 aa7.51□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 MYCBP2O75592 4640 aa7.51□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 FAT1Q14517 4588 aa7.51□□□□□ -1.21
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