RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-1.18□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-1.18□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-1.18□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-1.18□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 IL5P05113 134 aa-1.18□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 S100A7L2Q5SY68 101 aa-1.18□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 TRIQKQ629K1 86 aa-1.18□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-1.18□□□□□ -2.6
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SENP6-210ENST00000487548 HLA-DRB4P13762 266 aa-1.19□□□□□ -2.6
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SENP6-210ENST00000487548 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-1.19□□□□□ -2.6
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SENP6-210ENST00000487548 MIC13Q5XKP0 118 aa-1.21□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-1.21□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 ROCK1Q13464 1354 aa-1.21□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 ABCC5O15440 1437 aa-1.22□□□□□ -2.6
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SENP6-210ENST00000487548 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-1.22□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 NDUFA3O95167 84 aa-1.22□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 MT-ND4LP03901 98 aa-1.22□□□□□ -2.6
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SENP6-210ENST00000487548 NCS1P62166 190 aa-1.22□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 FAM223AQ8IWN6 122 aa-1.22□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
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SENP6-210ENST00000487548 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-1.24□□□□□ -2.61
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SENP6-210ENST00000487548 H3BQF6 201 aa-1.24□□□□□ -2.61
SENP6-210ENST00000487548 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-1.24□□□□□ -2.61
SENP6-210ENST00000487548 K7EP13 123 aa-1.24□□□□□ -2.61
SENP6-210ENST00000487548 MT1FP04733 61 aa-1.24□□□□□ -2.61
SENP6-210ENST00000487548 C3orf79P0CE67 100 aa-1.24□□□□□ -2.61
SENP6-210ENST00000487548 ASIPP42127 132 aa-1.24□□□□□ -2.61
SENP6-210ENST00000487548 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
SENP6-210ENST00000487548 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
SENP6-210ENST00000487548 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
SENP6-210ENST00000487548 TMEM244Q5VVB8 128 aa-1.24□□□□□ -2.61
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