RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486862.1

OPTN-211, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 423 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-211ENST00000486862 SPAG11BQ08648 103 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 CFAP161Q6P656 301 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 CEND1Q8N111 149 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 C15orf56Q8N910 161 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 SPANXCQ9NY87 97 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 EREGO14944 169 aa7.17□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 C2orf48Q96LS8 159 aa7.17□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 HIST1H4GQ99525 98 aa7.17□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.17□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 PTTG1IPP53801 180 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 CKS1BP61024 79 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 IFITM1P13164 125 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 C2orf82Q6UX34 121 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 Q6ZR54 194 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 SMIM13P0DJ93 91 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 GCSHP23434 173 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 FXYD2P54710 66 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 COX17Q14061 63 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 C6orf223Q8N319 242 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 ERG28Q9UKR5 140 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 USP17L23D6RBM5 183 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 C10orf25Q5T742 122 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 LYSTQ99698 3801 aa7.12□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 BATFQ16520 125 aa7.12□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.12□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.12□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.12□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.11□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 A0A1B0GWB2 263 aa7.11□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 A6NDN8 102 aa7.11□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.11□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.11□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.11□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.11□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 COPS9Q8WXC6 57 aa7.11□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.11□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.11□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 A0A0U1RRA0 63 aa7.1□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.1□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 A6NJY4 79 aa7.1□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 LINC00158P58513 81 aa7.1□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 RNF151Q2KHN1 245 aa7.1□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.1□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 DAND5Q8N907 189 aa7.1□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 A4D1N5 150 aa7.09□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 PSCAO43653 123 aa7.09□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 LY6G6CO95867 125 aa7.09□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 PFN2P35080 140 aa7.09□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 SYCNQ0VAF6 134 aa7.09□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 Q6ZRU5 148 aa7.09□□□□□ -1.27
OPTN-211ENST00000486862 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.08□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 M0R2N4 97 aa7.08□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 SLPIP03973 132 aa7.08□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 WFDC2Q14508 124 aa7.08□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 C14orf177Q52M58 125 aa7.08□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.07□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 A0A0B4J2C4 111 aa7.07□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.07□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 TAX1BP3O14907 124 aa7.06□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 CFC1BP0CG36 223 aa7.06□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 CFC1P0CG37 223 aa7.06□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 NPC2P61916 151 aa7.06□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 CARD19Q96LW7 228 aa7.06□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 DNAH2Q9P225 4427 aa7.06□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 TENM2Q9NT68 2774 aa7.05□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 LECT2O14960 151 aa7.05□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.05□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 TGP01266 2768 aa7.05□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.04□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.04□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 KMT2AQ03164 3969 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 K7ERJ3 54 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 NDUFC2O95298 119 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.03□□□□□ -1.28
OPTN-211ENST00000486862 A0A087WTM6 91 aa7.02□□□□□ -1.29
OPTN-211ENST00000486862 C9orf118A6NHY6 69 aa7.02□□□□□ -1.29
OPTN-211ENST00000486862 RAB37Q96AX2 223 aa7.02□□□□□ -1.29
OPTN-211ENST00000486862 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.02□□□□□ -1.29
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