RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486812.5

PRDM15-212, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM15, Length 7,072 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-212ENST00000486812 ZNF702PQ9H963 129 aa7.31□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.31□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.3□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 LITAFQ99732 161 aa7.3□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 A8MTW9 85 aa7.3□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 ROS1P08922 2347 aa7.3□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.29□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 Q9BRP9 147 aa7.29□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 CEP290O15078 2479 aa7.29□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 UQCR11O14957 56 aa7.29□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 PLA2G2AP14555 144 aa7.28□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 SPINK1P00995 79 aa7.28□□□□□ -1.24
PRDM15-212ENST00000486812 KIAA0087Q14695 138 aa7.27□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 A0A1B0GUV1 79 aa7.27□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 LINC01006Q8NI28 216 aa7.27□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 LINC01600Q96MT4 127 aa7.27□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 APC2O95996 2303 aa7.26□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.25□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 LINC00315P59091 139 aa7.25□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 NOTCH4Q99466 2003 aa7.25□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.24□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 Q6ZSN1 163 aa7.24□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 Q8NBF4 154 aa7.24□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.23□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV1-40P01703 118 aa7.23□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 LINC01554Q52M75 96 aa7.23□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 SORL1Q92673 2214 aa7.23□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 PTPRSQ13332 1948 aa7.22□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 LMO4P61968 165 aa7.21□□□□□ -1.25
PRDM15-212ENST00000486812 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.21□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.2□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.2□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.2□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 Q6ZRU5 148 aa7.2□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 PRLHP81277 87 aa7.2□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.19□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.19□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 PTPRBP23467 1997 aa7.19□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 LY6G6DO95868 133 aa7.19□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.19□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.19□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 WISP2O76076 250 aa7.19□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 ABCA4P78363 2273 aa7.18□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 DSCAMO60469 2012 aa7.17□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.17□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 Q6YL49 198 aa7.17□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 C19orf84I3L1E1 186 aa7.17□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 X6R8D5 127 aa7.16□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 SPTA1P02549 2419 aa7.16□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 SPTBN2O15020 2390 aa7.16□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 Q75L30 129 aa7.15□□□□□ -1.26
PRDM15-212ENST00000486812 ADAMTS20P59510 1910 aa7.15□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 K7EQZ3 153 aa7.15□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 MOBPQ13875 183 aa7.14□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 CREBBPQ92793 2442 aa7.14□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 CACNA1BQ00975 2339 aa7.14□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.13□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.13□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 CACNA1EQ15878 2313 aa7.13□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 C7orf33Q8WU49 177 aa7.13□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.12□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.12□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.12□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 ADORA2A-AS1P86434 159 aa7.12□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 A8MWP4 228 aa7.12□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.272e-6■■■□□ 16.4
PRDM15-212ENST00000486812 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.11□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 IGKV2-30P06310 120 aa7.11□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.11□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 NAV3Q8IVL0 2385 aa7.11□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.11□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.1□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 CRIPTQ9P021 101 aa7.1□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 LINC00167Q96N53 147 aa7.1□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV6-57P01721 117 aa7.1□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.09□□□□□ -1.27
PRDM15-212ENST00000486812 AVPP01185 164 aa7.09□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 Q6ZRX8 168 aa7.08□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 CACNA1HO95180 2353 aa7.08□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.08□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 C22orf24Q9Y442 160 aa7.08□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.08□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 CACNA1GO43497 2377 aa7.07□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.07□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 EPM2AB3EWF7 344 aa7.06□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 OCR1Q9BZK8 76 aa7.05□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.05□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 LRP4O75096 1905 aa7.04□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 Q6ZRP5 223 aa7.04□□□□□ -1.28
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