RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.54□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 Q6JHZ5 121 aa11.54□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.54□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 ORMDL1Q9P0S3 153 aa11.54□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.53□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 SNURFQ9Y675 71 aa11.53□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 COX7B2Q8TF08 81 aa11.52□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.52□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM89A2RUT3 159 aa11.52□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.51□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 CCL18P55774 89 aa11.51□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.51□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 AKAP9Q99996 3911 aa11.51□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.51□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 H0YGX0 51 aa11.51□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 CLPSL2Q6UWE3 100 aa11.51□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 FSHBP01225 129 aa11.5□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11.5□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 UBL5Q9BZL1 73 aa11.5□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.5□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV2D-28P01615 120 aa11.5□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.5□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 STHQ8IWL8 128 aa11.49□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa11.48□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 FAM236CP0DP71 79 aa11.48□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZTI0 123 aa11.48□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 ESM1Q9NQ30 184 aa11.48□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa11.48□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.48□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 UPK3BQ9BT76 320 aa11.48□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 INSP01308 110 aa11.47□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa11.47□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0U1RQV1 116 aa11.47□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 PF4P02776 101 aa11.47□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 RBM3P98179 157 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.46□□□□□ -0.57
CCSAP-204ENST00000483092 S100A7L2Q5SY68 101 aa11.46□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.46□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 CCL24O00175 119 aa11.45□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 XCL1P47992 114 aa11.45□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 ODF3L2Q3SX64 289 aa11.45□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2G2AP14555 144 aa11.45□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.45□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.45□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM86BQ8N661 226 aa11.45□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.44□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 SCXQ7RTU7 201 aa11.44□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa11.43□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 SMR3AQ99954 134 aa11.43□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 K7EQD1 137 aa11.42□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 Q5XG85 94 aa11.42□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 CCKP06307 115 aa11.42□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.41□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 BRK1Q8WUW1 75 aa11.41□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFC2O95298 119 aa11.4□□□□□ -0.58
CCSAP-204ENST00000483092 A0A096LPF7 62 aa11.4□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 RMI2Q96E14 147 aa11.4□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.39□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.39□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 A8MTW9 85 aa11.39□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.38□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 MPLKIPQ8TAP9 179 aa11.37□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 MRAPQ8TCY5 172 aa11.37□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 F8WEM9 126 aa11.37□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa11.37□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01006Q8NI28 216 aa11.36□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.35□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 WIPF1O43516 503 aa11.34□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf99Q4VX62 202 aa11.34□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 VWFP04275 2813 aa11.34□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa11.34□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB130BP0DP73 79 aa11.34□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB130AP0DP74 79 aa11.34□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 PDZD2O15018 2839 aa11.34□□□□□ -0.59
CCSAP-204ENST00000483092 ATRQ13535 2644 aa11.33□□□□□ -0.6
CCSAP-204ENST00000483092 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa11.33□□□□□ -0.6
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.33□□□□□ -0.6
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV10A0A0B4J240 114 aa11.32□□□□□ -0.6
CCSAP-204ENST00000483092 DAD1P61803 113 aa11.32□□□□□ -0.6
CCSAP-204ENST00000483092 Q8N814 137 aa11.32□□□□□ -0.6
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00474Q9P2X8 69 aa11.32□□□□□ -0.6
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CCSAP-204ENST00000483092 SERP1Q9Y6X1 66 aa11.3□□□□□ -0.6
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.29□□□□□ -0.6
CCSAP-204ENST00000483092 PRO0628Q9UI54 55 aa11.29□□□□□ -0.6
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa11.28□□□□□ -0.6
CCSAP-204ENST00000483092 M0R2N4 97 aa11.27□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 SS18Q15532 418 aa11.27□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 H7BZZ5 65 aa11.27□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV7A0A075B6U4 112 aa11.26□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.26□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.26□□□□□ -0.61
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB4AO15263 64 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms