RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482096.1

UBE2F-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative), human

TSL 4

Gene UBE2F, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2F-222	ENST00000482096		A0A1B0GW15	77 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBE2F-222	ENST00000482096	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF861P	O60384	105 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBE2F-222	ENST00000482096	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBE2F-222	ENST00000482096	C2orf82	Q6UX34	121 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBE2F-222	ENST00000482096	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
UBE2F-222	ENST00000482096	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		5.09	□□□□□ -1.59
UBE2F-222	ENST00000482096		D6R8Y8	96 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	NPY	P01303	97 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	NUPR1	O60356	82 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	TSPAN13	O95857	204 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	PPBP	P02775	128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096		A0A1B0GXF2	115 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096		F8W036	122 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	S100A8	P05109	93 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	RAB5A	P20339	215 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	ADIRF	Q15847	76 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM141	Q96I45	108 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	NAT8	Q9UHE5	227 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096		A0A087X002	238 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	PRSS47	A8MTI9	375 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096		C9JQL5	133 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	PRSS2	P07478	247 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096		Q6ZN92	141 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	AKAP14	Q86UN6	197 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	ORMDL3	Q8N138	153 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	PRELID3A	Q96N28	172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	BCE1	O60756	84 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	CRYGA	P11844	174 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	CKS1B	P61024	79 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096		Q8IZM0	81 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	AMELX	Q99217	191 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBE2F-222	ENST00000482096	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	VCX2	Q9H322	139 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		5.01	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		5.01	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	GAGE10	A6NGK3	116 aa		5	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	IGIP	A6NJ69	53 aa		5	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096		F8VRH5	84 aa		5	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	PEA15	Q15121	130 aa		5	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		5	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096		Q8N8P6	123 aa		5	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC00167	Q96N53	147 aa		5	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		5	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		5	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		5	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096		K7EMI3	77 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	CXCL5	P42830	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	HERVK_113	P63121	156 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	SEC11A	P67812	179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	CTAG1A	P78358	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBE2F-222	ENST00000482096	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	UBE2A	P49459	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	G0S2	P27469	103 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2F-222	ENST00000482096	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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