RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477700.1

RALGPS1-213, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-213ENST00000477700 Q9H8V8 135 aa6.69□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 A0A0J9YXY3 114 aa6.68□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 M0R143 59 aa6.68□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 TIMM17BO60830 172 aa6.68□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 HERV-K104P63124 156 aa6.68□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 SFTA2Q6UW10 78 aa6.68□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 MUC7Q8TAX7 377 aa6.68□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 LITAFQ99732 161 aa6.68□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.68□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.67□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.67□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 TM2D2Q9BX73 214 aa6.67□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 APOMO95445 188 aa6.66□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.66□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.66□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.66□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 TMEM238C9JI98 176 aa6.65□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 CXCL5P42830 114 aa6.65□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 Q6ZVH6 145 aa6.65□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.65□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.65□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.65□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 SPANXCQ9NY87 97 aa6.65□□□□□ -1.34
RALGPS1-213ENST00000477700 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.64□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 MALP21145 153 aa6.64□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 PTTG1IPP53801 180 aa6.64□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 CEND1Q8N111 149 aa6.64□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 C15orf56Q8N910 161 aa6.64□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 RMI2Q96E14 147 aa6.64□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.64□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.63□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.63□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.63□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 HIST1H4GQ99525 98 aa6.63□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.63□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 COX11Q9Y6N1 276 aa6.63□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.62□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 F8WDY8 70 aa6.62□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 PRSS2P07478 247 aa6.62□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 FXYD2P54710 66 aa6.62□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 SPAG11BQ08648 103 aa6.62□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 TTC32Q5I0X7 151 aa6.62□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 Q9HAA7 133 aa6.62□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 DNAH2Q9P225 4427 aa6.62□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 A0A1B0GWB2 263 aa6.61□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 IFITM1P13164 125 aa6.61□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 CFAP161Q6P656 301 aa6.61□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 C2orf82Q6UX34 121 aa6.61□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 C2orf48Q96LS8 159 aa6.61□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 C3orf84H3BNL1 204 aa6.6□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 GCSHP23434 173 aa6.6□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 CKS1BP61024 79 aa6.6□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 COX17Q14061 63 aa6.6□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.6□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 CASC10Q5T4H9 136 aa6.6□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 KMT2AQ03164 3969 aa6.59□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 SMIM13P0DJ93 91 aa6.59□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 BATFQ16520 125 aa6.59□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 C6orf223Q8N319 242 aa6.59□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 ERG28Q9UKR5 140 aa6.59□□□□□ -1.35
RALGPS1-213ENST00000477700 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.58□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 A6NDN8 102 aa6.58□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.58□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 C10orf25Q5T742 122 aa6.58□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.58□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 Q6ZR54 194 aa6.58□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.58□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.58□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.58□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.57□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.57□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 USP17L23D6RBM5 183 aa6.57□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.57□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.57□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 COPS9Q8WXC6 57 aa6.57□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 A4D1N5 150 aa6.56□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 TAX1BP3O14907 124 aa6.56□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 RNF151Q2KHN1 245 aa6.56□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.56□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.56□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 DAND5Q8N907 189 aa6.56□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.56□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.56□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 A0A0B4J2C4 111 aa6.55□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 H3BS24 57 aa6.55□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 CFC1BP0CG36 223 aa6.55□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 CFC1P0CG37 223 aa6.55□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 LINC00158P58513 81 aa6.55□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.55□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.55□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms