RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM238C9JI98 176 aa6.41□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 TIMM17BO60830 172 aa6.41□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 NUPR2A6NF83 97 aa6.4□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 HERV-K104P63124 156 aa6.4□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 KIAA0087Q14695 138 aa6.4□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.4□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 Q8IZM0 81 aa6.4□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.4□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 SPANXCQ9NY87 97 aa6.4□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.4□□□□□ -1.38
SRPRB-202ENST00000466636 A6NDN8 102 aa6.39□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 TAX1BP3O14907 124 aa6.39□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.39□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.38□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1B0GV90 55 aa6.38□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1B0GWB2 263 aa6.38□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.38□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 MALP21145 153 aa6.38□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 PTTG1IPP53801 180 aa6.38□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 SFTA2Q6UW10 78 aa6.38□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 K7ERJ3 54 aa6.37□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 APOMO95445 188 aa6.37□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 PRSS2P07478 247 aa6.37□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.37□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 Q6ZVH6 145 aa6.37□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.37□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 SMIM13P0DJ93 91 aa6.36□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 CXCL5P42830 114 aa6.36□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 SPAG11BQ08648 103 aa6.36□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.36□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 C2orf82Q6UX34 121 aa6.36□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.36□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.35□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 IFITM1P13164 125 aa6.35□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 CFAP161Q6P656 301 aa6.35□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 DAND5Q8N907 189 aa6.35□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 Q9HAA7 133 aa6.35□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 COX11Q9Y6N1 276 aa6.35□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.34□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 A0A0U1RRA0 63 aa6.34□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 A4D1N5 150 aa6.34□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 CKS1BP61024 79 aa6.34□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.34□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.34□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 C15orf56Q8N910 161 aa6.34□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.34□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.34□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.34□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 ERG28Q9UKR5 140 aa6.34□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SRPRB-202ENST00000466636 C9orf118A6NHY6 69 aa6.33□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 CFC1BP0CG36 223 aa6.33□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 CFC1P0CG37 223 aa6.33□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 C6orf223Q8N319 242 aa6.33□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 RAB37Q96AX2 223 aa6.33□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 RMI2Q96E14 147 aa6.33□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 A0A0B4J2C4 111 aa6.32□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00158P58513 81 aa6.32□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 NPC2P61916 151 aa6.32□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 C10orf25Q5T742 122 aa6.32□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.32□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.32□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.32□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 PFN2P35080 140 aa6.31□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.31□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 CASC10Q5T4H9 136 aa6.31□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.31□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 COPS9Q8WXC6 57 aa6.31□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 COL7A1Q02388 2944 aa6.31□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 H3BUT2 72 aa6.3□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 COX17Q14061 63 aa6.3□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 MUC7Q8TAX7 377 aa6.3□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 C2orf48Q96LS8 159 aa6.3□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 F8WDY8 70 aa6.29□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.29□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.29□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.28□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.28□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1W2PPM0 123 aa6.28□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 USP17L23D6RBM5 183 aa6.28□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 TSPAN13O95857 204 aa6.28□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.28□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.28□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 TGP01266 2768 aa6.28□□□□□ -1.4
SRPRB-202ENST00000466636 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.27□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 TTC32Q5I0X7 151 aa6.27□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 Q6ZRU5 148 aa6.27□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.27□□□□□ -1.41
SRPRB-202ENST00000466636 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.27□□□□□ -1.41
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