RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 UBE2D3P61077 147 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-215ENST00000462256 UBE2D2P62837 147 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-215ENST00000462256 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-215ENST00000462256 A0A096LNJ9 63 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-215ENST00000462256 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.5□□□□□ -1.37
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DDX39B-215ENST00000462256 HIGD1BQ9P298 99 aa6.48□□□□□ -1.37
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DDX39B-215ENST00000462256 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 HIST1H4GQ99525 98 aa6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 CNFNQ9BYD5 112 aa6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 hADV29S1A0JD25 119 aa6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.46□□□□□ -1.38
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DDX39B-215ENST00000462256 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 APLNQ9ULZ1 77 aa6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.45□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 PRO0628Q9UI54 55 aa6.45□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 LCE6AA0A183 80 aa6.44□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.44□□□□□ -1.38
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DDX39B-215ENST00000462256 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.44□□□□□ -1.38
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DDX39B-215ENST00000462256 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 USP17L23D6RBM5 183 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 PLNP26678 52 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 A0A0J9YXV3 536 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 Q6Q795 121 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-215ENST00000462256 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.41□□□□□ -1.38
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DDX39B-215ENST00000462256 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
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DDX39B-215ENST00000462256 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.39□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.39□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.39□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 FAM229AH3BQW9 127 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 TRACP01848 142 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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DDX39B-215ENST00000462256 A0A087WZ39 114 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 LINC01546A6NGU7 62 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF815PA8K554 130 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 RNF185Q96GF1 192 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 H3BS24 57 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 TSHBP01222 138 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.38□□□□□ -1.39
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DDX39B-215ENST00000462256 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.37□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 COX7B2Q8TF08 81 aa6.37□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.37□□□□□ -1.39
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DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A20O43772 301 aa6.37□□□□□ -1.39
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DDX39B-215ENST00000462256 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.37□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.37□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.36□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 J3QQQ9 107 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 UBE2AP49459 152 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 TOMM6Q96B49 74 aa6.35□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 NPC2P61916 151 aa6.34□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 NRACQ8N912 160 aa6.34□□□□□ -1.39
DDX39B-215ENST00000462256 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
DDX39B-215ENST00000462256 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.34□□□□□ -1.4
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