RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 LINC01600Q96MT4 127 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 NPSP0C0P6 89 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 C1orf137Q5JT78 98 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 PRSS2P07478 247 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 HERVK_113P63121 156 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 COX19Q49B96 90 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 ERASQ7Z444 233 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 Q8IZM0 81 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 LINC01546A6NGU7 62 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 M0QXV9 152 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 G0S2P27469 103 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 CKS1BP61024 79 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 REG3GQ6UW15 175 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 FA2HQ7L5A8 372 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-209ENST00000439106 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 SEC11AP67812 179 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 A0A096LNJ9 63 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 IGLV7-43P04211 117 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 SPINK8P0C7L1 97 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 UBE2BP63146 152 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 CST9LQ9H4G1 147 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 LRP2P98164 4655 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 TRGC2P03986 189 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP10-8P60410 259 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 PMCHL1Q16048 86 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 F8VRH5 84 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 PMVKQ15126 192 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 COX7B2Q8TF08 81 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 NDUFA6P56556 154 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-209ENST00000439106 LINC01549A6NIU2 74 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 CXCL5P42830 114 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 C22orf24Q9Y442 160 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 H0Y9J4 135 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 LINC00614P0C842 121 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 RAB5BP61020 215 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 DIRC1Q969H9 104 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 HBDP02042 147 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 IGLC3P0DOY3 106 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H2BKO60814 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H2BJP06899 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H2BOP23527 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H2BBP33778 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H2BDP58876 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H2BCP62807 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 H3BRM9 83 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 RNF213Q63HN8 5207 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PRAME-209ENST00000439106 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 GAGE10A6NGK3 116 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 C11orf86A6NJI1 115 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 BAGE3Q86Y29 109 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 PFN2P35080 140 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 ATP5LO75964 103 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 LINC00310P59036 64 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 LINC00167Q96N53 147 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 LPAP08519 4548 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 NUPR1O60356 82 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 ZNF861PO60384 105 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 SERF1AO75920 110 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 ERG28Q9UKR5 140 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PRAME-209ENST00000439106 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-209ENST00000439106 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.26□□□□□ -1.09
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