RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 FN1P02751 2386 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
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PTPRU-204ENST00000428026 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 CYSRT1A8MQ03 144 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 Q8N814 137 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 Q8IZM0 81 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 C7orf33Q8WU49 177 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 POLQO75417 2590 aa10.47□□□□□ -0.73
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PTPRU-204ENST00000428026 COX17Q14061 63 aa10.46□□□□□ -0.73
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PTPRU-204ENST00000428026 PSPHP1O15172 72 aa10.46□□□□□ -0.74
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PTPRU-204ENST00000428026 OXLD1Q5BKU9 147 aa10.44□□□□□ -0.74
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PTPRU-204ENST00000428026 PRYO14603 147 aa10.43□□□□□ -0.74
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PTPRU-204ENST00000428026 C1orf137Q5JT78 98 aa10.4□□□□□ -0.74
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PTPRU-204ENST00000428026 COX8CQ7Z4L0 72 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 LINC00337Q8N6G1 96 aa10.31□□□□□ -0.76
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PTPRU-204ENST00000428026 Q9UF83 564 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 HECTD1Q9ULT8 2610 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 H0Y9P7 68 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 LY6G6CO95867 125 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 CRYGAP11844 174 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 HTTP42858 3142 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 C4orf26Q17RF5 130 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 X6R8D5 127 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 PTPRBP23467 1997 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 SPINK1P00995 79 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 VPREB1P12018 145 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 C5orf42Q9H799 3197 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 Q8N2B8 174 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 AGRNO00468 2067 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 C16orf95Q9H693 158 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 Q9BRP9 147 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 EXPH5Q8NEV8 1989 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 PRO0461Q9UI25 63 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 F8P00451 2351 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 HCG22E2RYF7 251 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRU-204ENST00000428026 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRU-204ENST00000428026 BRI3O95415 125 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRU-204ENST00000428026 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRU-204ENST00000428026 RPS28P62857 69 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
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