RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 FSHBP01225 129 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 RETNQ9HD89 108 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 ESRGQ1W209 222 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf137Q5JT78 98 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 F8P00451 2351 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 ADAMTS20P59510 1910 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV1-40P01703 118 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 MUC4Q99102 2169 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 HTTP42858 3142 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 CDIP1Q9H305 208 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 CELA1Q9UNI1 258 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 MTORP42345 2549 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 NUPR2A6NF83 97 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 EDN2P20800 178 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 INAFM1C9JVW0 142 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF843Q8N446 348 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 LY6G6CO95867 125 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 hDV103S1A0JD37 113 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PPR1 153 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087WYN8 130 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 COX6A2Q02221 97 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 REG3GQ6UW15 175 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 LIMD2Q9BT23 127 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF702PQ9H963 129 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 Q8N814 137 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 M0R2N4 97 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 LRRK2Q5S007 2527 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01006Q8NI28 216 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 X6R8D5 127 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 BRI3O95415 125 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 AVPP01185 164 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 Q8N3U1 123 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00846Q9NV44 126 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 H0Y9P7 68 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 C2orf48Q96LS8 159 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 AMELXQ99217 191 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 Q8N2B8 174 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 LY6G6DO95868 133 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 Q9BRP9 147 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf223Q8N319 242 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 PCOTHQ58A44 107 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 BPTFQ12830 3046 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087WSZ3 146 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 SPINK1P00995 79 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZSN1 163 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 PRO0461Q9UI25 63 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 HCG22E2RYF7 251 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 PSPHP1O15172 72 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00575Q6W349 94 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 POLQO75417 2590 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 A8MTW9 85 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 PCSK5Q92824 1860 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GW54 56 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 BCE1O60756 84 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GUV1 79 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 CXCL6P80162 114 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GU69 56 aa6.28□□□□□ -1.4
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