RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 CRPP02741 224 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 PFN2P35080 140 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 Q8IZM0 81 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 IGKV2D-28P01615 120 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 CCL18P55774 89 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 XGP55808 180 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-202ENST00000398743 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-202ENST00000398743 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-202ENST00000398743 REG3AQ06141 175 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-202ENST00000398743 TRACP01848 142 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-202ENST00000398743 Q8N3U1 123 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-202ENST00000398743 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PRAME-202ENST00000398743 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.5□□□□□ -0.89
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PRAME-202ENST00000398743 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.5□□□□□ -0.89
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PRAME-202ENST00000398743 KRTAP10-11P60412 298 aa9.43□□□□□ -0.9
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PRAME-202ENST00000398743 PRR34Q9NV39 138 aa9.43□□□□□ -0.9
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PRAME-202ENST00000398743 KLK12Q9UKR0 248 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-202ENST00000398743 A0A087WYN8 130 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-202ENST00000398743 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.41□□□□□ -0.9
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PRAME-202ENST00000398743 RETNQ9HD89 108 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-202ENST00000398743 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
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PRAME-202ENST00000398743 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.4□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
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PRAME-202ENST00000398743 C22orf24Q9Y442 160 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 H3BNG1 76 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 ACYP1P07311 99 aa9.38□□□□□ -0.91
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PRAME-202ENST00000398743 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 C6orf223Q8N319 242 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 C3orf56Q8N813 242 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
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PRAME-202ENST00000398743 GAGE2EQ4V326 116 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 Q6ZTC4 211 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 MUC7Q8TAX7 377 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 TMEM126AQ9H061 195 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 TTC32Q5I0X7 151 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 C10orf25Q5T742 122 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-202ENST00000398743 A0A0J9YWU9 116 aa9.35□□□□□ -0.91
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PRAME-202ENST00000398743 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.34□□□□□ -0.91
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PRAME-202ENST00000398743 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 A0A1B0GX51 115 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 Q8NDZ9 215 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 SLPIP03973 132 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 Q8N814 137 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 LINC00167Q96N53 147 aa9.29□□□□□ -0.92
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