RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 SS18Q15532 418 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 PAX4O43316 350 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 MALP21145 153 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 XCL1P47992 114 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 CFAP161Q6P656 301 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 B5MCH6 92 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 H0YGX0 51 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 JMJD1CQ15652 2540 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.11□□□□□ -0.954e-11■□□□□ 9.7
PRAME-201ENST00000398741 A0A087WYN8 130 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 CCDC179H3BU77 68 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 C22orf24Q9Y442 160 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 F8P00451 2351 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 PRO0255Q9UI72 69 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 A0A096LPF7 62 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 A0A1B0GUV1 79 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 LINC00643Q86TS7 51 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 Q8IZM0 81 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 IMUPQ9GZP8 106 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 X6R8D5 127 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PRAME-201ENST00000398741 LECT2O14960 151 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 ATP5G1P05496 136 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP10-3P60369 221 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 HIVEP2P31629 2446 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 LYRM9A8MSI8 78 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 INAFM1C9JVW0 142 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 DEFB4AO15263 64 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 CXCL5P42830 114 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 DEFB135Q30KP9 77 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-201ENST00000398741 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 SLPIP03973 132 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 DAD1P61803 113 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 REG3AQ06141 175 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 COX17Q14061 63 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 NCR3O14931 201 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 APOC4P55056 127 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 KIAA0087Q14695 138 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 NDUFC2O95298 119 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 Q8N3U1 123 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 TMEM126AQ9H061 195 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 A0A1B0GX51 115 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
PRAME-201ENST00000398741 Q8N814 137 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 HTN3P15516 51 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 LINC00167Q96N53 147 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 LINC00846Q9NV44 126 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 CELA1Q9UNI1 258 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 MIFP14174 115 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 SPAG11BQ08648 103 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 Q6JHZ5 121 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 Q8NAQ8 132 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 CCKP06307 115 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 C6orf99Q4VX62 202 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 LELP1Q5T871 98 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 C3orf56Q8N813 242 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 UQCRQO14949 82 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 C6orf223Q8N319 242 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 ATOX1O00244 68 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 MUC7Q8TAX7 377 aa8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms