RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358071.8

RAD9B-201, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAD9B, Length 2,843 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9B-201ENST00000358071 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.91□□□□□ -1.62
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RAD9B-201ENST00000358071 C5orf47Q569G3 176 aa4.91□□□□□ -1.62
RAD9B-201ENST00000358071 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RAD9B-201ENST00000358071 C1orf43Q9BWL3 253 aa4.91□□□□□ -1.62
RAD9B-201ENST00000358071 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.91□□□□□ -1.62
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RAD9B-201ENST00000358071 TIRAPP58753 221 aa4.91□□□□□ -1.62
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RAD9B-201ENST00000358071 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.91□□□□□ -1.62
RAD9B-201ENST00000358071 CLEC2BQ92478 149 aa4.91□□□□□ -1.62
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RAD9B-201ENST00000358071 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
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RAD9B-201ENST00000358071 FOXI1Q12951 378 aa4.86□□□□□ -1.63
RAD9B-201ENST00000358071 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.86□□□□□ -1.63
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RAD9B-201ENST00000358071 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.84□□□□□ -1.63
RAD9B-201ENST00000358071 FRAS1Q86XX4 4008 aa4.84□□□□□ -1.63
RAD9B-201ENST00000358071 SEC61GP60059 68 aa4.84□□□□□ -1.63
RAD9B-201ENST00000358071 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.84□□□□□ -1.63
RAD9B-201ENST00000358071 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.84□□□□□ -1.63
RAD9B-201ENST00000358071 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.84□□□□□ -1.63
RAD9B-201ENST00000358071 PRO0461Q9UI25 63 aa4.84□□□□□ -1.63
RAD9B-201ENST00000358071 H7C423 109 aa4.83□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 NCR3O14931 201 aa4.83□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 CRPP02741 224 aa4.83□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 LINC01620Q4KN68 170 aa4.83□□□□□ -1.64
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RAD9B-201ENST00000358071 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.83□□□□□ -1.64
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RAD9B-201ENST00000358071 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.83□□□□□ -1.64
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RAD9B-201ENST00000358071 SLPIP03973 132 aa4.82□□□□□ -1.64
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RAD9B-201ENST00000358071 Q6ZRU5 148 aa4.8□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 C15orf56Q8N910 161 aa4.8□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.8□□□□□ -1.64
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