RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS2P07478 247 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00469Q8N7U9 141 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00614P0C842 121 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMVKQ15126 192 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBLN2Q8IUK8 224 aa12.15□□□□□ -0.46
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PTPRCAP-201ENST00000326294 GAGE2EQ4V326 116 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAGE2DQ9UEU5 116 aa12.14□□□□□ -0.47
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PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDZD11Q5EBL8 140 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa12.11□□□□□ -0.47
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PTPRCAP-201ENST00000326294 F8VRH5 84 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPINK8P0C7L1 97 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXCL5P42830 114 aa12.08□□□□□ -0.48
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PTPRCAP-201ENST00000326294 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 MT1HL1P0DM35 61 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFA6P56556 154 aa12.06□□□□□ -0.48
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PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMCN2Q8NDA2 5059 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BRM9 83 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0QXV9 152 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.04□□□□□ -0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPINK6Q6UWN8 80 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
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PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf86A6NJI1 115 aa12.01□□□□□ -0.49
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PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf137Q5JT78 98 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 BAGE3Q86Y29 109 aa12.01□□□□□ -0.49
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PTPRCAP-201ENST00000326294 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSBP1O75506 76 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2BP63146 152 aa11.96□□□□□ -0.49
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PTPRCAP-201ENST00000326294 IFI27L1Q96BM0 104 aa11.96□□□□□ -0.49
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PTPRCAP-201ENST00000326294 C22orf24Q9Y442 160 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERF1AO75920 110 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 ODF1Q14990 250 aa11.92□□□□□ -0.5
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PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.9□□□□□ -0.5
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ERG28Q9UKR5 140 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 PFN2P35080 140 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUPR1O60356 82 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 DIRC1Q969H9 104 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 H0Y9J4 135 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCO1O75880 301 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 LEPROTL1O95214 131 aa11.86□□□□□ -0.51
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PTPRCAP-201ENST00000326294 COX17Q14061 63 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00167Q96N53 147 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.84□□□□□ -0.51
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PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPB8Q9UJY1 196 aa11.81□□□□□ -0.52
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF861PO60384 105 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q8NDZ9 215 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCE1O60756 84 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H2BKO60814 126 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H2BJP06899 126 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H2BOP23527 126 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H2BBP33778 126 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H2BDP58876 126 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H2BCP62807 126 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST2H2BEQ16778 126 aa11.78□□□□□ -0.52
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