RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 PF4P02776 101 aa10.47□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 MRAPQ8TCY5 172 aa10.47□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa10.46□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 A8MTW9 85 aa10.46□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 K7EQD1 137 aa10.46□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 MPLKIPQ8TAP9 179 aa10.46□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCL19Q99731 98 aa10.46□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 CFAP46Q8IYW2 2715 aa10.46□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 TEX15Q9BXT5 2789 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 RMI2Q96E14 147 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 MSMBP08118 114 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLA2G2AP14555 144 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRORYQ9H606 182 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 K7ENP7 123 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB130BP0DP73 79 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB130AP0DP74 79 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLK9Q2XQG4 91 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCKP06307 115 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 DAD1P61803 113 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q5XG85 94 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAP6D1Q9H9H5 199 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 F8WEM9 126 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 NDUFC2O95298 119 aa10.41□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 C6orf99Q4VX62 202 aa10.4□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 GNLYP22749 145 aa10.4□□□□□ -0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa10.39□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 C11orf72Q8NBR9 251 aa10.39□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM89A2RUT3 159 aa10.38□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa10.38□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 J3QLI3 93 aa10.37□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00474Q9P2X8 69 aa10.37□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAV10A0A0B4J240 114 aa10.37□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 ESM1Q9NQ30 184 aa10.36□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa10.36□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 WFDC10AQ9H1F0 79 aa10.36□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.35□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8N814 137 aa10.35□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 F8P00451 2351 aa10.35□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 B4DSR2 109 aa10.35□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.34□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGSF10Q6WRI0 2623 aa10.34□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRCOL1A6NCL2 159 aa10.34□□□□□ -0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 C1orf158Q8N1D5 194 aa10.33□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 M0R2N4 97 aa10.32□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 SS18Q15532 418 aa10.32□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRO0628Q9UI54 55 aa10.32□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 SERP1Q9Y6X1 66 aa10.32□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.31□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 WIPF1O43516 503 aa10.31□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF843Q8N446 348 aa10.31□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8N3U1 123 aa10.31□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 UCNP55089 124 aa10.3□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8N9L7 120 aa10.3□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6ZQY7 126 aa10.3□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa10.29□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 H7BZZ5 65 aa10.29□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.29□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.28□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa10.28□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 TM2D3Q9BRN9 247 aa10.28□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 APCP25054 2843 aa10.28□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa10.28□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa10.28□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 ODF3L2Q3SX64 289 aa10.28□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMIM26A0A096LP01 95 aa10.27□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa10.27□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6ZVQ6 151 aa10.27□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 GYPEP15421 78 aa10.26□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 CR1P17927 2039 aa10.26□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A087WZ39 114 aa10.25□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 HTN3P15516 51 aa10.25□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP24Q9UPU5 2620 aa10.25□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa10.25□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 XAGE1AQ9HD64 81 aa10.25□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa10.24□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa10.24□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB4AO15263 64 aa10.23□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 MIFP14174 115 aa10.22□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 C1orf195Q5TG92 126 aa10.22□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 LYPD5Q6UWN5 251 aa10.22□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF702PQ9H963 129 aa10.22□□□□□ -0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPATA3Q8NHX4 192 aa10.21□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRR4Q16378 134 aa10.2□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB105AQ8NG35 78 aa10.2□□□□□ -0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A096LNT2 108 aa10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.9 ms