RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00862A6NCI5 91 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 IFITM2Q01629 132 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 RIGQ13278 110 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0087Q14695 138 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf82Q6UX34 121 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZN92 141 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 AMN1Q8IY45 258 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 DAND5Q8N907 189 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 OCC1Q8TAD7 63 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 HIGD1CA8MV81 97 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB5AP20339 215 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCL5P42830 114 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 CKS2P33552 79 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8IZM0 81 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00167Q96N53 147 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 HMSDA8MTL9 139 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 F8VRH5 84 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 SMKR1H3BMG3 65 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 K7EN84 100 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF6BO95407 300 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC11AP67812 179 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM141Q96I45 108 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 SPINK1P00995 79 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00310P59036 64 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 NRACQ8N912 160 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GW15 77 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 GAGE10A6NGK3 116 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM250H0YL14 139 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 SNAPINO95295 136 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 S100A8P05109 93 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 AKAP14Q86UN6 197 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 F8W036 122 aa4.45□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 PPBPP02775 128 aa4.45□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 HERVK_113P63121 156 aa4.45□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.45□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.45□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.45□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.45□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 VCX2Q9H322 139 aa4.45□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.45□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.44□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R2T5 61 aa4.44□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 CEBPGP53567 150 aa4.44□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 PRLHP81277 87 aa4.44□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 OSTCQ9NRP0 149 aa4.44□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.43□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.43□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV2D-28P01615 120 aa4.43□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 NPSP0C0P6 89 aa4.43□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 G0S2P27469 103 aa4.43□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01551Q86U37 167 aa4.42□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.42□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.42□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.42□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.42□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 D6R8Y8 96 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 SMLR1H3BR10 107 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A20O43772 301 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8NBF4 154 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM104AQ969W3 186 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM126AQ9H061 195 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1B-201ENST00000296642 MT1HP80294 61 aa4.4□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.4□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 ORMDL3Q8N138 153 aa4.4□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 K7EMI3 77 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5LO75964 103 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB5BP61020 215 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 BLOC1S1P78537 153 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-201ENST00000296642 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.39□□□□□ -1.71
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