RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF861P	O60384	105 aa		3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFC2	O95298	119 aa		3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616	CD7	P09564	240 aa		3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616	C3orf79	P0CE67	100 aa		3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616	PMCHL1	Q16048	86 aa		3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616	TDRG1	Q3Y452	100 aa		3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF182	Q8N6D2	247 aa		3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8TAT8	98 aa		3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616	CELA1	Q9UNI1	258 aa		3.22	□□□□□ -1.89
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A096LNJ9	63 aa		3.21	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		3.21	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	OVOL1	O14753	267 aa		3.21	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	LEPROTL1	O95214	131 aa		3.21	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	AMN1	Q8IY45	258 aa		3.21	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		3.21	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		3.21	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	C20orf202	A1L168	122 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf70	A6NJV1	201 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616		M0R143	59 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLC6	P0CF74	106 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM17	P0DL12	118 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	CKS2	P33552	79 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	SCX	Q7RTU7	201 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616		U3KQK5	164 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		3.2	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616		D6R8Y8	96 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA45	Q537H7	98 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6Q795	121 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	PRELID3A	Q96N28	172 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	CNFN	Q9BYD5	112 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A087WX48	190 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616		A8MWP4	228 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLL5	B9A064	214 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616		K7ERS5	55 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	ATOH7	Q8N100	152 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	RMI2	Q96E14	147 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.18	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		3.18	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	PANO1	I0J062	215 aa		3.18	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLC3	P0DOY3	106 aa		3.18	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		3.18	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616		Q5W150	140 aa		3.18	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		3.18	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		3.18	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		3.18	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	C3orf56	Q8N813	242 aa		3.18	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		3.18	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		3.18	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GV90	55 aa		3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	NPY	P01303	97 aa		3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	EMP1	P54849	157 aa		3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP10-3	P60369	221 aa		3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	DAND5	Q8N907	189 aa		3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	ST20	Q9HBF5	79 aa		3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	NCR2	O95944	276 aa		3.16	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	HBD	P02042	147 aa		3.16	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	EVI2A	P22794	236 aa		3.16	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	FCER1G	P30273	86 aa		3.16	□□□□□ -1.9
EFHC1-223	ENST00000636616	ASIP	P42127	132 aa		3.16	□□□□□ -1.9

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