RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636060.1

LIN28B-AS1-202, LIN28B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene LIN28B-AS1, Length 548 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.6□□□□□ -1.35
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C5orf38Q86SI9 138 aa6.6□□□□□ -1.35
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.6□□□□□ -1.35
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 AMELXQ99217 191 aa6.6□□□□□ -1.35
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.6□□□□□ -1.35
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PANO1I0J062 215 aa6.59□□□□□ -1.35
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 UBE2D1P51668 147 aa6.59□□□□□ -1.35
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.59□□□□□ -1.35
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.59□□□□□ -1.35
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FA2HQ7L5A8 372 aa6.59□□□□□ -1.35
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SCXQ7RTU7 201 aa6.59□□□□□ -1.35
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TIMM17AQ99595 171 aa6.59□□□□□ -1.35
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A0A096LNJ9 63 aa6.58□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 G0S2P27469 103 aa6.58□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 COX6A2Q02221 97 aa6.58□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.58□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.57□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.57□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MALP21145 153 aa6.57□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 Q6ZN92 141 aa6.57□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ERASQ7Z444 233 aa6.57□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.57□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.57□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 VCX2Q9H322 139 aa6.57□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LINC01549A6NIU2 74 aa6.56□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.56□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 Q5VSD8 79 aa6.56□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.56□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.56□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.56□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MYCBP2O75592 4640 aa6.55□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A0A087WZ39 114 aa6.55□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 EPM2AB3EWF7 344 aa6.55□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 APOMO95445 188 aa6.55□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LINC00614P0C842 121 aa6.55□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CHTF8P0CG12 524 aa6.55□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SPAG11BQ08648 103 aa6.55□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SYCNQ0VAF6 134 aa6.55□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.55□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 Q6ZRU5 148 aa6.55□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.55□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C2orf48Q96LS8 159 aa6.55□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CARD19Q96LW7 228 aa6.55□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 COLCA2A8K830 154 aa6.54□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.54□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.54□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A0A096LNI7 61 aa6.53□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A0A0J9YXV3 536 aa6.53□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 HBDP02042 147 aa6.53□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRGC2P03986 189 aa6.53□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KIAA0087Q14695 138 aa6.53□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PMCHL1Q16048 86 aa6.53□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.53□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.53□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.53□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.53□□□□□ -1.36
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SCO1O75880 301 aa6.52□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RAB5BP61020 215 aa6.52□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CST9LQ9H4G1 147 aa6.52□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.52□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A0A087WYN8 130 aa6.51□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.51□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FAM229AH3BQW9 127 aa6.51□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 HERVK_113P63121 156 aa6.51□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SEC11AP67812 179 aa6.51□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PMVKQ15126 192 aa6.51□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C10orf25Q5T742 122 aa6.51□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.5□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.5□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.5□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 F8WDY8 70 aa6.5□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LINC00310P59036 64 aa6.5□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RNF151Q2KHN1 245 aa6.5□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.5□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.5□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.49□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NDUFA1O15239 70 aa6.49□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MAJINQ3KP22 176 aa6.49□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C2orf82Q6UX34 121 aa6.49□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.49□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.49□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.48□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ATP5LO75964 103 aa6.48□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGLC3P0DOY3 106 aa6.48□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PTTG1IPP53801 180 aa6.48□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.48□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.47□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BAGE3Q86Y29 109 aa6.47□□□□□ -1.37
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 Q8IZM0 81 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms