RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	BUB3	O43684	328 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIAP1	O43715	76 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	STH	Q8IWL8	128 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	TOMM6	Q96B49	74 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	TENM2	Q9NT68	2774 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM223	A0PJW6	202 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	LST1	O00453	97 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	SH2D1A	O60880	128 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	COPS9	Q8WXC6	57 aa		5.27	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0U1RRA0	63 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	DAND5	Q8N907	189 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495		H7C2G1	150 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	LCE2C	Q5TA81	110 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	DCANP1	Q8TF63	244 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	COL7A1	Q02388	2944 aa		5.26	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495		U3KQE9	123 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8TAT8	98 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	ERCC8	Q13216	396 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	NRAC	Q8N912	160 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	C11orf86	A6NJI1	115 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	GAS8-AS1	O95177	125 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	HTN3	P15516	51 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	C8orf49	Q96NF6	230 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	PRAC2	D3DTV9	90 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495		K7EMT4	169 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	RHOH	Q15669	191 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	AMELX	Q99217	191 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0J9YX75	114 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6JHZ5	121 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM243	Q9BU79	118 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	NACA	E9PAV3	2078 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BRN7	92 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	SPRY2	O43597	315 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	FHL2	Q14192	279 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	USP17L23	D6RBM5	183 aa		5.21	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495		K7EQG2	157 aa		5.21	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		5.21	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	PDE6H	Q13956	83 aa		5.21	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		5.21	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.57
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		5.21	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		5.21	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		5.21	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		5.2	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0U1RQV1	116 aa		5.2	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	LEPROT	O15243	131 aa		5.2	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		5.2	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		5.2	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	CD164	Q04900	197 aa		5.2	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.2	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		5.2	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	IL17D	Q8TAD2	202 aa		5.2	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	CLEC2B	Q92478	149 aa		5.2	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB130B	P0DP73	79 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB130A	P0DP74	79 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	TIRAP	P58753	221 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		5.19	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0J9YWU9	116 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495		I3L3M4	83 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM141	Q96I45	108 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	APOC4	P55056	127 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58

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