RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 VCYO14598 125 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 NDUFA1O15239 70 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 TSPAN13O95857 204 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 UBE2BP63146 152 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 GAGE2EQ4V326 116 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 CT83Q5H943 113 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 BORCS7Q96B45 105 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.82□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 NRACQ8N912 160 aa7.82□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.82□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.82□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.81□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 A0A1B0GUT8 65 aa7.81□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 HIGD1CA8MV81 97 aa7.81□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 C9JQL5 133 aa7.81□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.81□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 FAM104AQ969W3 186 aa7.81□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 LINC01551Q86U37 167 aa7.8□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 KIR2DL4Q99706 377 aa7.8□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 ZNF727A8MUV8 499 aa7.79□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 ZNF861PO60384 105 aa7.78□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 TMEM18Q96B42 140 aa7.78□□□□□ -1.16
CTIF-211ENST00000592658 A0A087X002 238 aa7.77□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 PPP1R17O96001 155 aa7.77□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 KIAA0087Q14695 138 aa7.77□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 LCE2BO14633 110 aa7.76□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 PPP1R2P9O14990 202 aa7.76□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 IFITM10A6NMD0 228 aa7.75□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.75□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 C2orf82Q6UX34 121 aa7.75□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 OSTCQ9NRP0 149 aa7.75□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.75□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 V9GYV3 84 aa7.75□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.74□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 HBBP68871 147 aa7.74□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 RIGQ13278 110 aa7.74□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 PEA15Q15121 130 aa7.74□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.73□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 NUPR1O60356 82 aa7.73□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 ADIRFQ15847 76 aa7.73□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.73□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 C20orf78Q9BR46 151 aa7.73□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.72□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.72□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.72□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.72□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 NAT8Q9UHE5 227 aa7.72□□□□□ -1.17
CTIF-211ENST00000592658 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.71□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 CRYGAP11844 174 aa7.71□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.71□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.71□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 C22orf24Q9Y442 160 aa7.71□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 LINC00862A6NCI5 91 aa7.7□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 TCAPO15273 167 aa7.7□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 TPRXLQ17RH7 258 aa7.7□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 TNFRSF6BO95407 300 aa7.69□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 CKS2P33552 79 aa7.69□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.69□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 CDIP1Q9H305 208 aa7.69□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 IFITM2Q01629 132 aa7.68□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.68□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.68□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.68□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.68□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.67□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.67□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 BCE1O60756 84 aa7.67□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 NPYP01303 97 aa7.67□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 RAB14P61106 215 aa7.67□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 CLLU1Q5K131 121 aa7.67□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 D6R8Y8 96 aa7.66□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.66□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.65□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.65□□□□□ -1.18
CTIF-211ENST00000592658 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CTIF-211ENST00000592658 TMEM141Q96I45 108 aa7.64□□□□□ -1.19
CTIF-211ENST00000592658 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.64□□□□□ -1.19
CTIF-211ENST00000592658 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.63□□□□□ -1.19
CTIF-211ENST00000592658 PRSS2P07478 247 aa7.63□□□□□ -1.19
CTIF-211ENST00000592658 CKS1BP61024 79 aa7.63□□□□□ -1.19
CTIF-211ENST00000592658 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.63□□□□□ -1.19
CTIF-211ENST00000592658 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms