RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRGV2A0A075B6R0 118 aa17.11■□□□□ 0.33
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TIRAPP58753 221 aa17.11■□□□□ 0.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TIMM17BO60830 172 aa17.11■□□□□ 0.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPC2P61916 151 aa17.11■□□□□ 0.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GAGE5Q13069 117 aa17.04■□□□□ 0.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa17.04■□□□□ 0.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H7C423 109 aa17.04■□□□□ 0.32
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa17.01■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLEC2BQ92478 149 aa17.01■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa17■□□□□ 0.31
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C2orf82Q6UX34 121 aa17■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa16.99■□□□□ 0.31
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa16.98■□□□□ 0.31
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DEFB121Q5J5C9 76 aa16.89■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00612Q8N6U2 182 aa16.89■□□□□ 0.29
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM243Q9BU79 118 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OXLD1Q5BKU9 147 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C15orf53Q8NAA6 179 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COX7A2LO14548 114 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q6Q795 121 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COPS9Q8WXC6 57 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYSRT1A8MQ03 144 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MEIG1Q5JSS6 88 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C3orf56Q8N813 242 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BAHCC1Q9P281 2608 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HERV-K104P63124 156 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LYRM9A8MSI8 78 aa16.81■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GYPEP15421 78 aa16.8■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPDPFQ9H3Y8 114 aa16.8■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STAB1Q9NY15 2570 aa16.79■□□□□ 0.28
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