RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM27B	Q5VT28	67 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	PTPRS	Q13332	1948 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	C4A	P0C0L4	1744 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	C4B	P0C0L5	1744 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	MPDZ	O75970	2070 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	CLPS	P04118	112 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909		Q9BRP9	147 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	UBL5	Q9BZL1	73 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		3.4	□□□□□ -1.86
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	HMGN4	O00479	90 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	NRAP	Q86VF7	1730 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909		K7EMI3	77 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	PIN1P1	O15428	100 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909		Q6ZS52	159 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	SNURF	Q9Y675	71 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	MUC4	Q99102	2169 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	LRP6	O75581	1613 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A0J9YX75	114 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A0J9YY99	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	C17orf98	A8MV24	154 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909		F8VRH5	84 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A087WVE0	104 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGHV3-53	P01767	116 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRR15L	Q9BU68	103 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	LRRC37A3	O60309	1634 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPINK4	O60575	86 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPAG11B	Q08648	103 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	NREP	Q16612	68 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	C1orf137	Q5JT78	98 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	DMAC1	Q96GE9	116 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	EML5	Q05BV3	1969 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPTB	P11277	2137 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909		H3BQ85	93 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGKV1-17	P01599	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	COX6B1	P14854	86 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	LINC00846	Q9NV44	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	SVIL	O95425	2214 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	C10orf142	B7Z368	130 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	PDE6G	P18545	87 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	LYPD6	Q86Y78	171 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909		R4GMQ9	66 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOM1L1-222	ENST00000575909	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	MED13	Q9UHV7	2174 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	LCE6A	A0A183	80 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	ODF3B	A8MYP8	253 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	DEFA4	P12838	97 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	PDE6H	Q13956	83 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	ENHO	Q6UWT2	76 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1W2PNM2	257 aa		3.31	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGIP	A6NJ69	53 aa		3.31	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909		H0YGX0	51 aa		3.31	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909		I3L3M4	83 aa		3.31	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	FXYD3	Q14802	87 aa		3.31	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	CSAG1	Q6PB30	78 aa		3.31	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909		Q8TAT8	98 aa		3.31	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88

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