RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560890.5

APH1B-210, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-210ENST00000560890 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.86□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.86□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.86□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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APH1B-210ENST00000560890 A0A0J9YXV3 536 aa5.85□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.85□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 COX7A2LO14548 114 aa5.85□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 FOXI1Q12951 378 aa5.85□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.85□□□□□ -1.47
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APH1B-210ENST00000560890 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
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APH1B-210ENST00000560890 C5orf52A6NGY3 159 aa5.84□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 H0Y8G0 127 aa5.84□□□□□ -1.47
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APH1B-210ENST00000560890 COX6A2Q02221 97 aa5.84□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 C14orf177Q52M58 125 aa5.84□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.84□□□□□ -1.47
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APH1B-210ENST00000560890 PET117Q6UWS5 81 aa5.83□□□□□ -1.48
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APH1B-210ENST00000560890 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.83□□□□□ -1.48
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APH1B-210ENST00000560890 KRTDAPP60985 99 aa5.82□□□□□ -1.48
APH1B-210ENST00000560890 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.82□□□□□ -1.48
APH1B-210ENST00000560890 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.82□□□□□ -1.48
APH1B-210ENST00000560890 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
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APH1B-210ENST00000560890 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
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APH1B-210ENST00000560890 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.81□□□□□ -1.48
APH1B-210ENST00000560890 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.81□□□□□ -1.48
APH1B-210ENST00000560890 C3orf79P0CE67 100 aa5.81□□□□□ -1.48
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APH1B-210ENST00000560890 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.8□□□□□ -1.48
APH1B-210ENST00000560890 hDV102S1A0JD36 115 aa5.8□□□□□ -1.48
APH1B-210ENST00000560890 C20orf202A1L168 122 aa5.8□□□□□ -1.48
APH1B-210ENST00000560890 C11orf86A6NJI1 115 aa5.8□□□□□ -1.48
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APH1B-210ENST00000560890 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
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APH1B-210ENST00000560890 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
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APH1B-210ENST00000560890 HERVK_113P61574 105 aa5.77□□□□□ -1.49
APH1B-210ENST00000560890 C2orf48Q96LS8 159 aa5.77□□□□□ -1.49
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APH1B-210ENST00000560890 Q8IZM0 81 aa5.76□□□□□ -1.49
APH1B-210ENST00000560890 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.76□□□□□ -1.49
APH1B-210ENST00000560890 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.76□□□□□ -1.49
APH1B-210ENST00000560890 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.75□□□□□ -1.49
APH1B-210ENST00000560890 NDUFA1O15239 70 aa5.75□□□□□ -1.49
APH1B-210ENST00000560890 SCGB1D1O95968 90 aa5.75□□□□□ -1.49
APH1B-210ENST00000560890 CXCL5P42830 114 aa5.75□□□□□ -1.49
APH1B-210ENST00000560890 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
APH1B-210ENST00000560890 KIAA0087Q14695 138 aa5.75□□□□□ -1.49
APH1B-210ENST00000560890 COX7B2Q8TF08 81 aa5.75□□□□□ -1.49
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