RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 E2F6O75461 281 aa-0.6□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 Q8N8P6 123 aa-0.6□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.6□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 AMELXQ99217 191 aa-0.6□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 NAA60Q9H7X0 242 aa-0.6□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-0.6□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 SPANXA1Q9NS26 97 aa-0.6□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 SPEF2Q9C093 1822 aa-0.6□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 TCHHQ07283 1943 aa-0.6□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 IFT140Q96RY7 1462 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 BTAF1O14981 1849 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 IGLC7A0M8Q6 106 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 MGPP08493 103 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 IGLC6P0CF74 106 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 ALX1Q15699 326 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 KCNRGQ8N5I3 272 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 CDC26Q8NHZ8 85 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 FAIMQ9NVQ4 179 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 SMPXQ9UHP9 88 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 GINS2Q9Y248 185 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 HMGXB3Q12766 1538 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 KIAA0556O60303 1618 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-0.61□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 DISP2A7MBM2 1401 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 K7ERU9 68 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 M0R2Z0 102 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 SFT2D2O95562 160 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 MT1AP04731 61 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 NEFHP12036 1026 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 MGST2Q99735 147 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 DDA1Q9BW61 102 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 CRIPTQ9P021 101 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 GSKIPQ9P0R6 139 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 PSME4Q14997 1843 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 PBRM1Q86U86 1689 aa-0.62□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 COL12A1Q99715 3063 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 OVOS2Q6IE36 1432 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 I3L3M4 83 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 FABP1P07148 127 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00694P0DN24 101 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 MORN2Q502X0 79 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM3Q9BZL3 60 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 A0A0C4DFX4 3053 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 ADGRB1O14514 1584 aa-0.63□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 SLIT1O75093 1534 aa-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 COL4A6Q14031 1691 aa-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 H3BNG1 76 aa-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 HMGN4O00479 90 aa-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 UBE2D3P61077 147 aa-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 UBE2D2P62837 147 aa-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 C12orf73Q69YU5 71 aa-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 AKAP14Q86UN6 197 aa-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 COPS9Q8WXC6 57 aa-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 LINC01600Q96MT4 127 aa-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 PRO1933Q9H354 126 aa-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 MYH7P12883 1935 aa-0.64□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-0.65□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 TSPAN19P0C672 248 aa-0.65□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 IGLC1P0CG04 106 aa-0.65□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 SEC11AP67812 179 aa-0.65□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 BTG2P78543 158 aa-0.65□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 SMCO1Q147U7 214 aa-0.65□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 HEPN1Q6WQI6 88 aa-0.65□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 TCEAL4Q96EI5 215 aa-0.65□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-0.65□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 AIF1LQ9BQI0 150 aa-0.65□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 A0A0G2JMZ2 1700 aa-0.65□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms